数字农科院2.0

柑橘CitPG34的克隆、定位与表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 葛廷;黄雪;谢让金

作者机构:

关键词: 柑橘;多聚半乳糖醛酸酶;基因表达;亚细胞定位;启动子;幼果脱落

期刊名称:中国农业科学

ISSN: 0578-1752

年卷期: 2019 年 19 期

页码: 3404-3416

摘要: [目的]多聚半乳糖醛酸酶是一类参与细胞壁降解的水解酶,在植物生长发育和器官脱落过程中发挥着重要作用.本研究克隆柑橘CitPG34及其启动子(CitPG34-P)并进行表达分析,为深入研究柑橘PG在幼果脱落过程的生物功能奠定基础.[方法]以'塔罗科'血橙(Citrus sinensis L. Osbeck)为材料,克隆CitPG34及其启动子,利用ProtParam、Cello、CLUSTALX、MEGA5.2、PlantCARE等软件对其蛋白特性及启动子顺式作用元件进行分析预测;利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析CitPG34在不同组织以及柑橘幼果脱落过程中的表达水平.采用同源重组的方法构建pCAMBIA1302-CitPG34-GFP融合蛋白表达载体和CitPG34启动子表达载体(CitPG34-P::gus),分别用于亚细胞定位和启动子活性分析.[结果]从'塔罗科'血橙幼果离层中克隆获得CitPG34,其ORF为1 194 bp,编码397个氨基酸,预测蛋白分子量为41.47 kD,理论等电点为5.19,其不稳定系数为30.23,表明CitPG34属于稳定蛋白;通过在线软件TMHMM分析发现:CitPG34为跨膜蛋白,具有一个跨膜结构,位于第7-29位氨基酸之间.在CitPG34二级结构中,α-螺旋结构约占15.37%,扩展链约占29.72%,无规则卷曲约占54.91%,与其三级结构预测基本一致.NJ树分析显示CitPG34与西洋梨PcPG3(BAF42034)亲缘关系最近,表明CitPG34可能与果实脱落和软化相关.qRT-PCR分析表明,CitPG34在花中表达量最高,在根、叶、离层A、离层C中表达量较低,在幼果中几乎不表达.1-氨基环丙烷羧酸(ACC)处理果梗后能显著提高离层A中CitPG34的表达水平,相反IAA抑制其转录.此外,在柑橘幼果正常脱落过程中,CitPG34表达明显升高.亚细胞定位发现,CitPG34主要位于细胞壁.克隆获取CitPG34起始密码子(ATG)前2 075 bp启动子序列(CitPG34-P),PlantCare预测发现,在CitPG34-P序列上存在多种顺式调控元件,如核心启动元件TATA-box、增强子元件CAAT-box以及脱落酸响应元件ABRE等.将CitPG34-P::gus转入烟草,通过GUS组织化学染色发现,该启动子受乙烯诱导,主要在叶脉和毛状体中表达.[结论]CitPG34的ORF长度为1 194 bp,可编码397个氨基酸,其蛋白主要位于细胞壁;该基因具有明显的组织特异性,在花中表达最高;CitPG34表达量与柑橘幼果脱落显著相关.上述结果表明,CitPG34在柑橘幼果脱落和花发育过程中可能发挥着重要的生物功能.

分类号: Q943.2`S666

  • 相关文献

[1]响应黄龙病侵染的柑橘乙醇脱氢酶基因CsADH1的克隆与表达分析. 谢竹,赵珂,郑林,龙俊宏,杜美霞,何永睿,陈善春,邹修平. 2020

[2]茶树己糖激酶基因CsHXK2的启动子克隆及表达特性分析. 李娜娜,刘莹,张豪杰,王璐,郝心愿,张伟富,王玉春,熊飞,杨亚军,王新超. 2020

[3]柑橘黄化脉明病毒的TGB基因生物信息学分析及亚细胞定位. 崔甜甜,王艳娇,李中安,周常勇,宋震. 2017

[4]柑橘R2R3-MYB类转录因子CitMYB20的克隆与表达分析. 范海芳,彭蕴,张庆雯,何永睿,邹修平,李强,彭爱红,许兰珍,雷天刚,陈善春,姚利晓. 2019

[5]柑橘CsTBL1启动子的克隆及其在转基因拟南芥中的活性分析. 陈娇,吴天利,张军,钟广炎. 2014

[6]烟草赤霉素2-氧化酶基因NtGA2ox1的克隆、表达及亚细胞定位分析. 姜山,代常波,孙玉合. 2020

[7]普通烟草CESA基因家族成员的鉴定、亚细胞定位及表达分析. 徐宗昌,孔英珍. 2017

[8]玉米PDI基因家族鉴定和表达模式分析. 吴金丽,汤泽洋,鲁鑫,周志强,郭长虹,李新海. 2023

[9]玉米蔗糖转运蛋白基因ZmERD6cDNAs的克隆与逆境条件下的表达. 马小龙,刘颖慧,袁祖丽,石云素,宋燕春. 2009

[10]甘蔗中性/碱性转化酶基因SoNIN1的克隆和表达分析. 王爱勤,黄静丽,杨丽涛,李杨瑞. 2014

[11]茶树镁离子螯合酶H亚基基因CsChlH的克隆及其表达分析. 叶玙璠,王誉洁,傅前媛,王璐,郝心愿,丁长庆,王新超,曹红利,李娜娜. 2024

[12]柑橘响应黄龙病侵染的韧皮部蛋白2基因CsPP2B15的克隆与表达分析. 文庆利,谢竹,吴柳,何永睿,陈善春,邹修平. 2018

[13]溃疡病菌侵染早期柑橘细胞程序性死亡的响应特征及机制. 龙琴,谢宇,许兰珍,何永睿,邹修平,陈善春. 2020

[14]柑橘CCD基因家族鉴定及CcCCD4a对果肉颜色的影响. 张亚飞,彭洁,朱延松,杨胜男,王旭,赵婉彤,江东. 2020

[15]CsAREB转录因子在柑橘果实发育中的作用. 庞少萍,董翠翠,马岩岩,钱春,何绍兰,谢让金,邓烈. 2017

[16]柑橘低氧应答基因CsHRP的克隆、亚细胞定位及表达分析. 陈娇,马岩岩,张军,杨雪莲,钟广炎,朱世平,陆智明. 2016

[17]柑橘CitERF9和CitAP2-7在不同逆境和外源激素处理下的表达. 董翠翠,马岩岩,谢让金,邓烈,易时来,吕强,郑永强,何绍兰. 2016

[18]柑橘U-box基因家族的鉴定及表达分析. 李秋月,张亚飞,彭洁,王旭,张志强,戴祥生,江东. 2019

[19]柑橘转录因子基因CitMYB22的分离、表达及亚细胞定位分析. 李永杰,马岩岩,谢让金,何绍兰,易时来,吕强,郑永强,王武,邓烈. 2016

[20]柑橘CjGH3.4和CjGH3.7基因的生物信息学分析及表达分析. 庞少萍,谢让金,马岩岩,钱春,何绍兰,易时来,吕强,郑永强,邓烈. 2015

作者其他论文 更多>>