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Argonaute1敲除前后尖孢镰刀菌转录组分析比较

文献类型： 中文期刊

作者： 梁丽琴;杜海燕;段江燕;谢丙炎

作者机构：

关键词： 转录组分析;尖孢镰刀菌;Argonaute1

期刊名称：植物病理学报

ISSN： 0412-0914

年卷期： 2019 年 5 期

页码： 621-631

摘要： Argonaute蛋白(AGO)介导的沉默复合体在RNA干扰(RNAi)中起着至关重要的作用.为了探究AGO1在尖孢镰刀菌RNAi中的作用机制,本文以粘团专化型尖孢镰刀菌生理1号小种FOX-A8野生型和其AGO1缺失突变体(FOX-A8-△Ago1)的菌丝和孢子为材料,分别进行了RNA提取、Illumina Hi Seq 2000高通量转录组测序、差异表达基因(DEGs)的显著富集分析;选择菌丝和孢子中的DEGs进行实时荧光定量PCR(Quantitative real-time PCR,qRT-PCR)验证.GO通路注释结果显示,相对于野生型菌株,AGO1缺失突变体菌丝中的醇脱氢酶(NADP~+)、孢子中的CAMK/CAMKL/CHK 1蛋白激酶均显著上调; KEGG通路注释结果显示,相对于野生型菌株,AGO1缺失突变体菌丝中与MAPK信号通路相关的基因、孢子中与PLD信号通路相关的基因均显著下调;另外,相对于野生型菌株,编码AGO2的基因下调,但是下调不显著.qRT-PCR检测DEGs的表达模式与RNA-Seq分析结果一致,证实了RNA-Seq结果的可靠性.

分类号： S432.44

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