水貂ASIP基因单倍型检测及其皮肤组织mRNA差异表达分析
文献类型: 中文期刊
作者: 宋兴超;刘琳玲;王淑明;宋姗姗;徐超;杨童奥;刘宗岳;丛波;张志明;杨福合;彭英华
作者机构:
关键词: 水貂;ASIP基因;单倍型;差异表达;被毛颜色
期刊名称:中国畜牧兽医
ISSN: 1671-7236
年卷期: 2019 年 10 期
页码: 2998-3006
摘要: 试验旨在探究鼠灰色(agouti signaling protein,ASIP)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)形成的单倍型及皮肤组织差异表达mRNA对水貂被毛色素沉积的影响.通过PCR扩增、Sanger测序技术对金州黑水貂、红眼白水貂和名威银蓝水貂ASIP基因进行SNPs单倍型检测分析,利用实时荧光定量PCR技术检测3种毛色皮肤组织ASIP基因的表达量,分析单倍型及mRNA差异表达与毛色表型的相关性.结果表明,301个样本中共检测到10个SNPs,内含子2中4个SNPs(G18A、A159G、G235T、C1189T)共形成10种单倍型(Hap1~Hap10),其中Hap1(GAGC)和Hap2(GAGT)是3种不同毛色水貂群体的共享单倍型;部分内含子3中6个SNPs(C252T、A290C、G298C、A340G、T343C、T379C)形成4种单倍型(Hap1~Hap4),且Hap2(CCCGCC)是名威银蓝水貂群体的主体单倍型.5个位点(A290C、G298C、A340G、T343C、T379C)均处于完全连锁不平衡状态.实时荧光定量PCR检测显示,金州黑水貂和名威银蓝水貂ASIP基因mRNA表达量分别是红眼白水貂的1.25和0.95倍,三者间差异不显著(P>0.05).研究结果初步提示,ASIP基因调控水貂不同毛色表型形成的分子机制可能存在差异.
分类号: S865.22
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