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中国李品种"秋姬"基因组Survey测序分析

文献类型： 中文期刊

作者： 黄振宇;申飞;夏乐晗;陈龙;陈玉玲

作者机构：

关键词： 李;基因组;Survey测序

期刊名称：中国南方果树

ISSN： 1007-1431

年卷期： 2020 年 NULL 卷 3 期

页码： 102-104

收录情况： 北大核心（2020版） ; 农林核心（2020版） ; 科技核心（2020版）

摘要： 中国李是重要的落叶果树之一,具有较高的经济价值与生态价值,但其全基因组信息尚未被解析,限制了相关研究的深入开展.通过二代基因组Survey测序分析,对中国李品种"秋姬"全基因组信息进行初步解析,质控后共获得22.9 Gb高质量数据,经17-mer分析,预估其基因组大小为305.6 Mb,基因组杂合度为0.92%,属于高杂合中型基因组;采用SOAPdenovo软件进行组装,所得Contig N50为440 bp,Scaffold总长约为267 Mb.后续拟用第三代测序技术进行精细组装.

分类号： S662.3

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