草地贪夜蛾雄性成虫和5龄幼虫的转录组比较分析
文献类型: 中文期刊
作者: 廖永林;李燕芳;杨斌;赵华;高燕;陈伟平;蔡时可;王继华
作者机构:
关键词: 草地贪夜蛾;发育阶段;嗅觉基因;转录组;基因注释;生物信息学
期刊名称:昆虫学报
ISSN: 0454-6296
年卷期: 2020 年 NULL 卷 5 期
页码: 523-532
收录情况: 北大核心(2020版) ; CSCD(2020-2021年度) ; 农林核心(2020版) ; 科技核心(2020版)
摘要: [目的]草地贪夜蛾Spodoptera frugiperda是一种新近入侵我国的重要害虫.本研究旨在对草地贪夜蛾雄性成虫和5龄幼虫两个不同发育阶段的转录组进行比较分析.[方法]利用高通量测序技术对草地贪夜蛾雄性成虫和5龄幼虫进行转录组测序和数据组装,并对转录组数据进行功能注释和比较分析.[结果]经de novo组装共获得209 002条转录本,平均长度为687.55 bp,N50为982 bp.共有46 198条(57.43%) unigene在至少一个数据库中获得功能注释,其中1 713条(2.13%) unigene在所有数据库中均能获得注释.在GO数据库中获得205 269条unigene的注释,主要包括68个功能分类;在KEGG数据库中共有3 408条unigene得到注释,涉及277个代谢通路.共鉴定到424个嗅觉相关的基因,并且在雄性成虫和5龄幼虫之间的表达存在差异.通过比较转录组分析,在雄性成虫中鉴定到9 162个上调和6 399个下调差异表达基因(DEGs);功能富集分析发现在上调DEGs中涉及信息素以及信号转导的代谢通路显著富集,而下调DEGs中涉及解毒相关的通路显著富集.[结论]这些转录组数据为探究草地贪夜蛾的生长发育、嗅觉相关功能基因以及候选分子靶标提供资源信息.
分类号: S433.4
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