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芝麻坏死花叶病毒（SNMV）部分cDNA合成及序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 晏立英;陈坤荣;韩成贵;张宗义;于嘉林;许泽永

作者机构：

关键词： cDNA合成;芝麻;坏死花叶病毒;序列分析;外壳蛋白原因;同源性

期刊名称：中国油料作物学报

ISSN： 1007-9084

年卷期： 2002 年 24 卷 2 期

页码： 61-66

收录情况： CSCD

摘要： 提取芝麻坏死花叶病毒RNA，反转录合成cDNA，对滞后重组质粒进行点杂交，得到阳性克隆并且测定序列。经计算机分析，获得3368个核苷酸（nt)的序列。该序列含有一个完整的开放阅读框架（ORF),该ORF由1134nt组成，推测编码377个氨基酸，分子量为40．047×10^3道尔顿（Da)。经比较它与Tombusviride科中Avreusvirus属石柑子潜隐病毒（Pothos laten virus,PoLV)，Tombusvirus属病毒Cymbidium ringspot virus(CRSV)外壳蛋白（CP)氨基酸序列同源性分别为40．7％，40．1％，其起始氨基酸Tombusvirus ,Aureusvirus属另外的病毒CP起始氮基酸具有很高的保守性。根据这个完整ORF所编码蛋白的大小，与CRSV，PoLV病毒CP具一定的同源性，CP5’端氨基酸的保守性，推测这个完整的ORF可能包含该病毒的外壳蛋白基因，并且这个病毒可能类似PoLV病毒，是Tombusviride科Aureusvirus属的一种新病毒。

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