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应用rpoB和16S rDNA基因的变性梯度凝胶电泳技术对山羊瘤胃细菌多样性的研究

文献类型： 中文期刊

作者： 石鹏君;柏映国;袁铁铮;姚斌;范云六

作者机构：

关键词： DGGE;16S;rDNA基因;编码RNA聚合酶β亚基（rpoB）基因;瘤胃细菌;遗传多样性

期刊名称：微生物学报

ISSN： 0001-6209

年卷期： 2007 年 47 卷 2 期

页码： 285-289

收录情况： CSCD

摘要： 采用免培养的rpoB和16SrDNA基因的变性梯度凝胶电泳技术（DGGE）对3种山羊（波尔山羊，内蒙古绒山羊，四川南江黄羊）瘤胃细菌优势菌群结构进行了比较分析。研究结果显示rpoBDGGE图谱中条带数目少于16SrDNA图谱，并且条带分离效果明显，更有利于分析瘤胃细菌群落组成。从两种DGGE图谱中均可以发现3种山羊瘤胃细菌具有一定的相似性，种内个体间相似性明显高于种间相似性，这说明寄主品种是影响瘤胃细菌种群构成的一个重要因素。同时进行了部分优势细菌16SrDNA基因v6-v8区序列的系统发育分析。基因序列分析表明，DGGE图谱中优势条带的16SrDNA基因序列中有4条克隆的序列与基因库最相似菌的相似性大于97％，余下的克隆序列相似性在89％～96％之间，其中13条序列的与之相似性最高的序列均来自于未被鉴定的瘤胃细菌。

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