基于高分辨率熔解曲线的烟草突变体筛选体系构建和优化
文献类型: 中文期刊
作者: 杨文武;张芳;米其利;黄海涛;李凤霞;高茜
作者机构:
关键词: 烟草;高分辨率熔解曲线;单核苷酸多态性
期刊名称:分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2024 年
页码:
收录情况: 北大核心(2023版) ; ; 科技核心(2024版) ; ; 农林核心(2020版)
摘要: 高分辨率熔解曲线分析(high resolution melting curve analysis, HRM)是在实时荧光定量PCR基础上发展起来的一项鉴定碱基差异的新技术。本研究旨在构建和优化烟草EMS诱变群体中突变位点鉴定的HRM最佳体系。试验结果表明,在20 μL反应体系中Master Mix Eva Green Dye染料0.4 μL、引物浓度0.3 μmol/L、DNA模板浓度80~100 ng/μL,扩增子500 bp以下SNP分型较好。通过优化的HRM分型方法,在EMS诱变的红花大金元M2代突变体库中对烟草空泡蛋白基因AP24进行突变体筛选,共筛选到12个突变体,突变体的测序验证表明这些位点均发生了相应的点突变,突变体检出的阳性率为100%。本研究建立的烟草SNP基因分型体系适合一次试验对单位点、多个体的SNP鉴定和快速分型,在烟草EMS诱变突变基因筛选中具有较大的应用价值。
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