基于转录组测序的金银花提取物抗鸽源新城疫病毒感染的作用机制研究
文献类型: 中文期刊
作者: 莫红芳;石宗承;杨燕燕;俸云;虞霖田;石德顺;熊晓妍
作者机构:
关键词: 鸽;新城疫病毒;金银花;转录组测序;差异表达基因;天然免疫
期刊名称:畜牧与饲料科学
ISSN: 1672-5190
年卷期: 2024 年 45 卷 4 期
页码:
收录情况: 科技核心(2024版) ; ; 农林核心(2020版)
摘要: [目的]探究金银花提取物抗鸽源新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)感染的作用机制。[方法]选取未接种NDV疫苗的健康28日龄美国王鸽40只,适应性饲养7 d,于35日龄随机分为金银花预防(KO)组和攻毒对照(OE)组,每组20只。KO组试验鸽于35日龄开始在饮水中添加1.2%的金银花提取物,持续饮用7 d,42日龄时肌肉注射HA效价为5log2的鸽源NDV Pi/NJ/CH/4416/2016株0.5 mL/只;OE组试验鸽于35日龄进入正式试验,正常饮水,42日龄时肌肉注射HA效价为5log2的鸽源NDV Pi/NJ/CH/4416/2016株0.5 mL/只。攻毒7 d后,每组选取3只试验鸽采集脾脏组织样本制备组织切片,同时提取总RNA构建转录组文库,利用转录组测序(RNA-sequencing,RNA-Seq)技术进行差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)鉴定、GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。随机选取4个显著差异表达基因,利用qRT-PCR验证测序结果。[结果]OE组鸽子脾细胞核异常增大且出现白色空泡,并伴有大量粒细胞浸润,而KO组脾脏组织仅见较多白色空泡和少量粒细胞浸润,未见脾细胞核异常增大。利用RNA-Seq技术从KO组鸽脾脏中共鉴定出374个DEGs,其中,112个基因表达显著上调,262个基因表达显著下调。GO功能富集分析显示,共有875个DEGs富集到312个GO条目,其中,生物学过程富集到149个条目,细胞组成过程富集到33个条目,分子功能过程富集到130个条目。KEGG通路富集分析显示,共有226个DEGs主要被富集在信息传递通路、代谢通路、天然免疫相关通路、细胞凋亡通路等93条KEGG信号通路。qRT-PCR验证结果显示,从DEGs中随机选取的4个显著差异表达基因(LOC110360702、LOC110360688、SFRP5、CHAD)的相对mRNA丰度变化趋势与RNA-Seq结果显示的4个基因变化趋势一致。[结论]金银花提取物通过激活宿主的信息传递、代谢调节及免疫应答等重要生理过程发挥抗鸽源NDV感染作用。研究结果为进一步探究鸽源NDV感染中免疫应答的分子机制提供了科学依据。
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