数字农科院2.0

人参PgPP2C2基因的克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 梁浩;张亚玉;孙海;李美佳;张正海;邵财;王莹

作者机构：

关键词： 人参(Panax ginseng);PP2C2基因;生物信息学分析

期刊名称：分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2023 年 21 卷 16 期

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; ; 科技核心（2023版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 2C型蛋白磷酸酶(PP2C)是最大的蛋白磷酸酶家族,PP2C蛋白在响应不同非生物胁迫中发挥着重要作用。为了探究人参Pg PP2C2基因的功能,基于实验室前期转录组数据库,从人参中克隆了一个2C型蛋白磷酸酶基因,命名为Pg PP2C2,并对Pg PP2C2基因的序列、编码蛋白质的结构进行分析,预测了其功能。研究结果表明,该核苷酸序列的开放阅读框为1269 bp,编码422个氨基酸。其编码蛋白质属于亲水性蛋白,无信号肽,未形成跨膜结构域,包含2C家族丝氨酸/苏氨酸磷酸酶催化结构域。通过蛋白互作分析,发现Pg PP2C2蛋白与HOG1(参与渗透调节的丝裂原活化蛋白激酶)和NBP2(NAP1-binding蛋白2,参与HOG途径的蛋白)的互作分数分别高达0.996和0.984,推测Pg PP2C2蛋白可能参与渗透胁迫调节及磷酸化过程。本研究结果可为后期进一步研究PgPP2C2基因的功能和开展人参种植调控提供理论基础。

分类号：

  • 相关文献

[1]苹果蠹蛾8个烟碱型乙酰胆碱受体基因的克隆与生物信息学分析. 郭金梦,罗嘉鹏,冯丽凯,李飞,林克剑,王桂荣. 2018

[2]柑橘黄化脉明病毒的TGB基因生物信息学分析及亚细胞定位. 崔甜甜,王艳娇,李中安,周常勇,宋震. 2017

[3]ghr-miR160负调控棉花叶片衰老机理研究. 段珊,窦玲玲,程帅帅,郭亚宁,庞朝友,马启峰,魏恒玲,范术丽,王寒涛,喻树迅. 2018

[4]甘蔗蔗糖转运蛋白SoSUT5基因克隆、表达及功能鉴定. 牛俊奇,苗小荣,王道波,杨丽涛,李杨瑞. 2018

[5]奶水牛固醇携带蛋白2基因克隆、生物信息学分析及其组织表达检测. 梁莎莎,庞春英,邓廷贤,马小娅,陆杏蓉,段安琴,梁贤威. 2018

[6]水牛甲状旁腺素1受体基因CDS区克隆与生物信息学分析. 陆杏蓉,梁贤威,梁莎莎,邓廷贤,段安琴,马小娅,庞春英. 2018

[7]牦牛A-FABP基因的克隆与生物信息学分析. 秦文,阎萍,裴杰,吴晓云,李天科. 2013

[8]猪蛔虫感染相关基因28A02的表达谱及其全长cDNA的克隆和分析. 黄翠琴,廖生钱,王寿昆,黄其春,郑新添,朱兴全. 2010

[9]乳铁蛋白在犊牛生产中的应用及其生物信息学分析. 张蓉,刁其玉. 2007

[10]脑心肌炎病毒VP2基因编码蛋白的生物信息学分析及纳米PCR快速检测方法的建立. 罗亚坤,王静,史利军,梁琳,蔺文成,崔尚金. 2015

[11]β-氨基丁酸诱导番茄根基因的表达及其功能初步分析. 陈霄,谢丙炎,杨宇红,冯兰香. 2006

[12]水牛促卵泡素受体(FSHR)基因启动子克隆、生物信息学分析及转录活性检测. 朱鹏,庞春英,邓廷贤,段安琴,陆杏蓉,陈明棠,杨炳壮,梁贤威. 2015

[13]捕食线虫性真菌—少孢节丛孢菌粘附蛋白基因的克隆及生物信息学分析. 陈双庆,孟庆玲,乔军,赵海龙,王国超,赵新霞,罗建勋,才学鹏. 2013

[14]枳根cDNA全长文库的构建与分析. 姚利晓,王金萍,何永睿,雷天刚,许兰珍,彭爱红,邹修平,陈善春. 2015

[15]西瓜嗜酸菌tatB基因生物信息学分析. 杨玉文,王铁霖,杨姗姗,赵廷昌. 2014

[16]烟粉虱溶菌酶基因的鉴定及表达分析. 王登杰,雷仲仁,王海鸿. 2016

[17]大豆中GmKAB1基因的克隆和信息学分析. 朱晓玲,郝青南,陈海峰,王程,陈李淼,沙爱华,陈水莲,周蓉,周新安. 2014

[18]小偃麦异附加系TaXTH基因的克隆与生物信息学分析. 黄春丽,宋静,李全权,郭庆东,田秋菊,高居荣,王洪刚,封德顺. 2015

[19]猪多潜能性维持因子5cDNA全序列的克隆与分析. 李勇,王立刚,王立贤,乔丽娟,张龙超,颜华. 2010

[20]RACE法克隆亚麻COMT基因及生物信息学分析. 龙松华,乔瑞清,陈信波,邱财生,邓欣,郭媛,郝冬梅,王玉富. 2013

作者其他论文 更多>>