燕麦幼苗对低氮胁迫响应的表型及转录组分析
文献类型: 中文期刊
作者: 柴明娜;朱志强;路素香;王婷;王媛;张安旗;强泽;王梦旭;王媛媛;韩冰;林克剑
作者机构:
关键词: 燕麦;低氮胁迫;表型;转录组分析
期刊名称:中国草地学报
ISSN: 1673-5021
年卷期: 2024 年 46 卷 07 期
页码:
收录情况: 北大核心(2023版) ; ; CSCD(2023-2024年度) ; ; 科技核心(2024版) ; ; 农林核心(2020版)
摘要: 本研究对燕麦低氮不敏感材料As581和低氮敏感材料As533幼苗(3叶1心期)进行低氮胁迫处理,于胁迫处理12 h采集根系和叶片进行转录组测序,以期揭示燕麦低氮胁迫相关的分子及信号通路,同时为低氮胁迫响应候选基因的克隆与功能验证奠定基础。结果表明,与As581相比,低氮条件下敏感材料As533株高、叶绿素含量、氮含量、叶长、叶宽、叶面积、根冠比、最长主根长和根面积的差异更明显。低氮条件下,As581中有466个差异表达基因,As533中有1090个差异表达基因,两个材料叶片中的差异表达基因均比根系多,且多为下调。GO分析表明,As533和As581根系和叶片生物学过程都富集到代谢过程,细胞组分都富集到细胞和细胞组分,分子功能都富集到催化活性、结合和转运活性。KEGG分析表明,As533根系和叶片都富集在苯丙氨酸代谢、植物昼夜节律、淀粉和蔗糖代谢通路,As581根系和叶片都富集在氮代谢、ABC转运、TCA循环、氧化磷酸化以及丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢通路中。RT-qPCR分析表明,6个低氮相关差异表达基因的表达量变化趋势与RNA-seq结果一致。
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