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绿豆C2H2型锌指蛋白转录因子家族鉴定及非生物胁迫下的表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张均;郭飞翔;田文仲;李春霞;马超

作者机构：

关键词： 绿豆;C2H2锌指蛋白转录因子;生物信息学;共线性分析;基因表达

期刊名称：核农学报

ISSN： 1000-8551

年卷期： 2025 年 39 卷 09 期

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2025-2026年度） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2024版）

摘要： C2H2型锌指转录因子家族在植物非生物胁迫应答和生长发育等生命过程中起着重要的调控作用。为明确C2H2型锌指转录因子家族在绿豆生长发育中的功能，本研究利用绿豆（Vigna radiata L.）基因组数据和生物信息学技术鉴定了C2H2转录因子，对其理化性质、系统进化、染色体定位、共线性、启动子顺式作用元件及基因结构做了预测分析，并通过绿豆转录组数据和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析了其在不同组织与非生物胁迫下的表达模式。结果表明，共鉴定到60个C2H2转录因子成员，其中53个分布于9条染色体，7个成员染色体信息未知；Motif1和Motif3是绿豆C2H2转录因子家族所特有的保守基序，Motif3则是部分C2H2转录因子家族成员所特有的一段保守序列“QALGGH”；编码155～1 581个氨基酸，均为亲水性蛋白且均定位在细胞核中；系统进化将绿豆C2H2转录因子家族分为7个亚组（V1～V7）。共线性分析表明，片段复制事件均进行了纯化选择；启动子顺式作用元件分析表明，绿豆C2H2基因启动子区含有大量与生长发育、逆境胁迫和激素相关的响应元件；基因表达分析表明，叶柄、叶片、下胚轴、籽粒种皮中表达量较高（FPKM值大于10）的基因分别占25.0%、26.7%、20.0%、26.7%;qRT-PCR分析发现，VrC2H2-22和VrC2H2-46对于温度胁迫具有特异性的调控作用，VrC2H2-51对干旱胁迫的响应程度较强。本研究结果为进一步对绿豆C2H2锌指转录因子家族的功能研究提供了理论基础。

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