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蠋蝽病毒Arma chinensis virus-1基因组克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 孙梅雪;张长华;高强;李炜;贾芳曌;徐蓬军;任广伟

作者机构：

关键词： 蠋蝽;Arma chinensis virus-1;基因组结构;系统进化

期刊名称：烟草科技

ISSN： 1002-0861

年卷期： 2021 年 54 卷 12 期

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; CSCD（2020-2021年度） ; 农林核心（2020版） ; 科技核心（2020版）

摘要： 为明确天敌昆虫蠋蝽病原物的基因组结构,利用高通量测序技术,在蠋蝽体内发现了一种新的正义单链RNA病毒,并将其命名为Arma chinensis virus-1(AcV-1)。利用PCR和RACE扩增获得了含有完整读码框的AcV-1基因组序列,除Poly(A)外,其基因组长度为9192 nt,包含2个开放阅读框(Open reading frames,ORFs)。ORF1长5316 nt,编码一个含1771个氨基酸的非结构蛋白,包含3个保守结构域,分别是依赖RNA的RNA聚合酶、蛋白酶和RNA解旋酶；ORF2长2529 nt,编码一个含842个氨基酸的结构蛋白。AcV-1基因组序列与蟋蟀麻痹病毒(Cricket paralysis virus,CrPV,GenBank:KP974707.1)的相似性(89.40%)最高。根据序列同源性、基因组结构和聚类分析表明,AcV-1是蟋蟀麻痹病毒属(Cripavirus)的一个新成员。AcV-1在供试蠋蝽样本中侵染率为37.67%。

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