数字农科院2.0

栽培稻抽穗期基因OsFD1的遗传多样性及单倍型分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王银婷;周雷娜;吴比;李梓萱;逄洪波;郑晓明

作者机构：

关键词： 栽培稻;抽穗期;OsFD1;单倍型

期刊名称：植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2025 年

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2025-2026年度） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2024版）

摘要： 栽培稻（Oryza sativa L.）是全球重要的粮食作物，其抽穗期直接影响区域适应性和产量。OsFD1是调控栽培稻抽穗期的关键基因，但其遗传多样性及功能变异尚未充分研究。本研究通过重测序技术对192份栽培稻和58份野生稻样本进行OsFD1基因的核苷酸多态性和单倍型分析，并结合抽穗期数据探讨其功能。结果表明，OsFD1基因编码区和启动子区共包含1个InDel和18个SNP变异，形成7种编码区单倍型（Chap， Coding region haplotype）和6种启动子区单倍型（Phap， Promoter region haplotype）。功能单倍型分析表明，OsFD1编码区的5个变异（21292259 bp，CCT缺失；21292352 bp，C→A；21292370 bp，T→C；21292477 bp，G→A；21292634 bp，T→C）与栽培稻抽穗期显著相关，且CCT缺失导致FACHd3a形成过程中氢键缺失。启动子区分析发现，籼稻（Phap2 : Aus）在-1995 bp处发生T→A变异，导致GATA-motif元件缺失，而粳稻保留了完整的GATA-motif元件，可能与亚种间抽穗期差异相关。野生稻在OsFD1编码区未发现特有变异，表明栽培稻驯化过程中不同变异逐步固定于不同群体，同时栽培稻产生了新的变异，导致抽穗期多样性。OsFD1的自然变异和单倍型多样性为栽培稻适应不同光周期和气候条件提供了遗传基础，反映了栽培稻的适应性进化，并为分子育种提供了潜在靶点。进一步研究OsFD1的功能和调控机制将有助于精准调控抽穗期，推动栽培稻品种改良。

分类号：

  • 相关文献

[1]水稻长日抑制基因PhyB的多样性及区域适应性初探. 刘莎,郑晓明,冯雳,乔卫华,王君瑞,公婷婷,梁新霞,齐兰,苏龙,丁膺宾,许睿,张丽芳,程云连,杨庆文. 2017

[2]水稻耐寒基因CTB4a的核苷酸多样性及区域适应性研究. 宋佳,职铭阳,陈强,李玥莹,吴隆坤,农保选,李丹婷,逄洪波,郑晓明. 2021

[3]中国栽培稻及其近缘野生种叶绿体DNA的限制性片段长度. 肖晗,应存山,黄大年. 1996

[4]稻属种间杂种花粉植株的细胞遗传学研究. 颜辉煌,胡慧英,张雪琴,张志涛,田淑兰,熊振民,闵绍楷. 1997

[5]不对称体细胞杂交转移疣粒野生稻对水稻白叶枯病的抗性. 朱永生,陈葆棠,余舜武,张端品,张雪琴,颜秋生. 2004

[6]栽培稻与紧穗野生稻间整倍体后代的RFLP分析. 刘国庆,颜辉煌,罗耀武,闵绍楷,朱立煌,ss10.igtp.ac.cn. 1999

[7]疣粒野生稻与栽培稻体细胞杂交创造种质的研究简要. 严成其. 2001

[8]紧穗野生稻的褐飞虱抗性导入栽培稻的研究. 颜辉煌,熊振民,闵绍楷,胡慧英,张志涛,田淑兰,汤圣祥. 1997

[9]野生稻与栽培稻体细胞杂交第4代特性研究初报. 皇甫伟国,应成波,裘尧军,陈国,严成其,颜秋生. 2001

[10]栽培稻抗旱性研究的现状与策略. 罗利军,张启发. 2001

[11]稻属种间杂交转移药用野生稻抗褐飞虱基因研究. 钟代彬,罗利军,应存山. 1997

[12]中国栽培稻同工酶的遗传多样性. 汤圣祥,江云珠,魏兴华,李自超,余汉勇. 2002

[13]栽培稻的紧穗野生稻抗褐飞虱主效基因的遗传定位. 刘国庆,颜辉煌,傅强,钱前,张志涛,翟文学,朱立煌. 2001

[14]读《印度农业史》,评普通栽培稻种起源问题. 俞履圻. 1989

[15]栽培稻抗旱性相关性状QTL定位及分子育种研究进展. 聂元元,蔡耀辉,付红,李永辉,毛凌华,颜龙安,余瑞新,罗军元,颜满. 2011

[16]部分栽培稻和野生稻种子谷蛋白的电泳分析. 湛小燕,林榕辉. 1991

[17]广东雷州杂草稻生物学特性研究. 杨红梅,冯莉,田兴山,陆永良,岳茂峰,杨彩宏,余柳青. 2011

[18]栽培稻抗旱性指标的相关研究. 董国军,郭龙彪,藤本 宽,杨春梅,李惠钢,曾大力,滕胜,钱前. 2003

[19]稻属种间杂种(Oryzasativa×O.officinalis)回交世代的形态学研究. 钟代彬,罗利军,郭龙彪,梅捍卫,王一平,应存山. 1997

[20]栽培稻旱胁迫叶片相关性状的遗传解析(英文). 郭龙彪,钱前,曾大力,董国军,滕胜,朱立煌. 2004

作者其他论文 更多>>