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北京地区1株鸽圆环病毒全基因组测定及遗传进化分析

文献类型： 中文期刊

作者： 亓玉卓;梁琳;韩坤;梁瑞英;贾亚雄;崔尚金

作者机构：

关键词： 鸽圆环病毒（PiCV）;全基因组;遗传进化分析

期刊名称：中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2022 年 01 期

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; 科技核心（2021版） ; 农林核心（2020版）

摘要： 【目的】了解北京地区流行的鸽圆环病毒（Pigeon circovirus,PiCV）的基因组特征及变异规律。【方法】以3只发病鸽的肝脏和脾脏组织为模板，采用PCR技术检测病原。以检测阳性的肝脏组织DNA为模板，应用PCR技术分段扩增PiCV的全基因序列。应用DNAStar和Mega 7.0软件对扩增得到的全序列进行拼接和核苷酸序列比对，并构建系统进化树，对病毒基因组的2个开放阅读框分别进行核苷酸和氨基酸序列比对，并构建系统进化树。【结果】经PCR检测，3只病鸽中有1只病鸽的组织中检测到PiCV阳性，并未检出其他病毒。采用PCR分段扩增成功获得了1株PiCV的全基因组序列，命名为PiCV BJ，该病毒基因组大小为2 034bp，包含有2个主要的开放阅读框（ORFs）,ORF-V1编码Rep蛋白，ORF-C1编码Cap蛋白。相似性比对结果显示，PiCV BJ株基因组序列与GenBank上登录的其他参考序列的核苷酸相似性在86.0%～97.0%之间，与2011年分离自波兰的PL53相似性为97.0%。遗传进化结果显示，PiCV BJ株与2014年分离自波兰的PL124在同一分支，亲缘关系较近；与其他禽源圆环病毒不在同一分支，亲缘关系较远。PiCV BJ株Cap基因的起始密码子为ATG，与2011年分离自比利时的11-08304株核苷酸、氨基酸序列相似性高达95.8%和85.2%;Rep基因与2011年分离自波兰的PL53相似性最高，核苷酸和氨基酸相似性分别高达94.6%和96.2%;Cap和Rep基因的进化树分析结果也显示，PiCV BJ株均与PL53和11-08304株在同一分支，亲缘关系较近，这与相似性分析的结果一致。【结论】PiCV BJ株来自国外，可能由赛鸽引种传入中国，提示在外部引种时要做好病毒监测。本研究丰富了PiCV的遗传学研究资料，为进一步探究PiCV的遗传变异及传播机制提供了参考依据，也为PiCV的防控提供了重要的理论基础。

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