比较转录组分析揭示耐盐和盐敏感水稻对盐胁迫的分子响应机制
文献类型: 中文期刊
作者: 曾力旺;叶晓雪;铁韦韦;徐建龙;丁泽红;艾治勇;胡伟
作者机构:
关键词: 水稻;盐胁迫;转录调控;转录因子;转录组
期刊名称:分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2024 年
页码:
收录情况: 北大核心(2023版) ; ; 科技核心(2024版) ; ; 农林核心(2020版)
摘要: 为了探究不同品种水稻响应盐胁迫的分子机制,本研究以耐盐水稻品种海稻86和盐敏感水稻品种五山丝苗为研究材料,利用含有200 mmol/L NaCl的霍格兰溶液分别对其进行6、24和72 h盐胁迫处理,并通过转录组测序分析不同品种水稻在盐胁迫下的响应基因和调控网络。结果表明,相较于盐敏感品种,盐胁迫6、24和72 h后在海稻86中分别鉴定到848、1092和1189个特异性盐响应基因。GO富集分析结果显示,这些基因主要参与非生物逆境相关的生物学过程,如氧化还原酶活性、运输和胁迫响应,以及时间特异性生物学过程,如基因表达调控在6 h富集,细胞稳态和光合生物合成过程分别在24和72 h富集。KEGG分析结果显示,这些基因参与了乙烯和脱落酸触发的MAPK信号通路。此外,本研究还鉴定到33个转录因子家族中的188个转录因子,共表达网络分析揭示了在不同时间点与耐盐性状密切相关的8个基因模块。结合共表达网络和转录因子结合位点分析结果,构建了以AP2.1,MYB1,WRKY45,ERF1等20个转录因子为核心的调控网络,这些转录因子可能是调控水稻耐盐性的关键候选基因。本研究为理解不同品种水稻的盐胁迫响应机制提供了新的见解,并为培育耐盐水稻提供了基因资源。
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