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茶树GRF转录因子的比较基因组学和杂种优势

文献类型： 中文期刊

作者： 侯炳豪;王鹏杰;郭永春;王丽;谷梦雅;张兴坦;叶乃兴

作者机构：

关键词： 茶树;铁观音;黄棪;GRF转录因子;比较基因组;杂种优势

期刊名称：应用与环境生物学报

ISSN： 1006-687X

年卷期： 2022 年 28 卷 6 期

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2023版）

摘要： 生长调控因子(growth-regulation factor,GRF)是植物在调控生长发育中起重要作用的一类转录因子.利用生物信息学的方法,在铁观音、黄棪和舒茶早3个茶树基因组进行GRF基因家族的比较基因组分析,分别鉴定获得15、16和14个CsGRF基因家族成员,均具有完整的QLQ和WRC特征结构域.基于系统进化关系可将CsGRF分为6组,同一分组的基因结构与蛋白保守基序相似.CsGRF启动子上存在大量与光响应、激素响应与胁迫响应相关的顺式作用元件.不同组织转录组数据分析表明,CsGRF在茶树的幼嫩芽叶中表达量高,成熟叶和根中表达量低甚至不表达.荧光定量结果发现,铁观音CsGRF表达量明显低于黄棪的表达量；人工杂交F1代品种间CsGRF表达量存在差异,金观音CsGRF的表达量整体上稍高于母本铁观音,但不显著；黄观音CsGRF3、CsGRF7、CsGRF10、CsGRF12的表达量显著高于母本铁观音,CsGRF2、CsGRF5、CsGRF6、CsGRF14呈现超高亲表达,且CsGRF2达到显著水平；金牡丹CsGRF3和CsGRF5的表达量显著高于母本；紫玫瑰CsGRF的表达量除CsGRF6外均高于铁观音,CsGRF1、CsGRF2、CsGRF4、CsGRF5、CsGRF9和CsGRF14呈现超高亲表达,且除了CsGRF9外均达到显著水平.本研究推测部分CsGRF在杂交子代中的优势表达可能与茶树生长势杂种优势的形成有关.(图7表2参34)

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