玉竹蔗糖合成酶(SUS)基因家族的鉴定、表达分析及PoSUS1基因的克隆
文献类型: 中文期刊
作者: 潘根;秦裕辉;张水寒
作者机构:
关键词: 玉竹;SUS基因家族;表达分析;PoSUS1
期刊名称:热带作物学报
ISSN: 1000-2561
年卷期: 2023 年
页码:
收录情况: 北大核心(2020版) ; ; CSCD(2023-2024年度) ; ; 科技核心(2023版) ; ; 农林核心(2020版)
摘要: 多糖是玉竹的质量标志物,在免疫调节、抗肿瘤等方面具有显著的药理作用。作为多糖合成的关键酶之一,蔗糖合成酶(sucrose synthase,SUS)一直是揭示植物多糖合成的重要研究内容。基于转录组序列信息,本研究利用生物信息学手段对玉竹SUS基因家族及其成员进行鉴定,并利用荧光定量PCR(qPCR)对其成员表达模式进行分析。研究表明,玉竹转录组共获得8个具有ORF序列的PoSUS基因家族成员,其编码蛋白质含有111~310个氨基酸,分子量为12.81~35.43 kDa,其理论等电点范围为5.83~9.18;系统进化树分析表明,8个PoSUS基因家族成员可分为3个亚家族,其中第ⅠⅡ亚家族基因成员数目最多;亚细胞定位预测显示大多数PoSUS蛋白定位在叶绿体。基因表达模式分析表明PoSUS1和PoSUS6基因在多糖积累的根茎组织中表达量最高,且高多糖种质“HN1”中PoSUS1和PoSUS2表达量显著高于低多糖种质“AH2”。此外,本研究还从种质“HN1”和“AH2”克隆得到PoSUS1基因CDS序列,其编码蛋白在两份种质间存在3处氨基酸差异,且这些差异位于PoSUS1蔗糖合成酶结构域。研究结果为深入研究玉竹SUS基因功能奠定基础,也为玉竹药用品质形成分子机制研究提供理论依据。
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