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基于F2和RIL群体鉴定棉花抗黄萎病主效QTL

文献类型： 中文期刊

作者： 赵云雷;王文菊;陈伟;王海红;朱喜霞;杨继华;鲁宁宁;赵佩;桑晓慧;崔艳利;敦磊;王红梅

作者机构：

关键词： 棉花;黄萎病;QTL定位;重组自交系;基因挖掘

期刊名称：棉花学报

ISSN： 1002-7807

年卷期： 2023 年 2 期

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2023版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： [目的]通过对棉花抗黄萎病性状进行数量性状位点(quantitative trait locus,QTL)定位,鉴定可以应用于育种实践的能稳定检测到的主效QTL,为棉花抗黄萎病遗传改良奠定分子基础.[方法]以抗黄萎病品种中植棉 2 号和感黄萎病品种冀棉 11 号为亲本杂交的F2 群体和重组自交系(recombinant inbred lines,RIL)群体作为作图群体,在对 2 个群体进行多环境黄萎病抗性鉴定和简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)分子标记检测的基础上进行遗传连锁图谱构建,利用完备区间作图法进行QTL定位,并对获得的主效QTL置信区间进行候选基因挖掘.[结果]在F2:3 家系和RIL群体中共检测到 7 个抗黄萎病QTL,能够在多个环境条件下重复检测到的QTL有 4 个,包括qVW-D05-1、qVW-D05-2、qVW-D05-4和qVW-D05-5.共线性分析表明上述 4个QTL集中分布于D05 染色体上 2 293 776～3 205 058 bp和 62 407 897～62 582 344 bp 2 个区域.4 个抗性QTL的聚合可以显著降低棉花黄萎病病情指数.qVW-D05-1在多个环境中的表型变异解释率均在 10%以上,为抗黄萎病主效QTL.对qVW-D05-1置信区间内的基因进行了功能注释、黄萎病菌诱导后的表达模式分析和单 核 苷 酸 多 态 性(single nucleotide polymorphism,SNP)变 异 分 析,初 步 推 测 Ghir_D05G038990、Ghir_D05G039060、Ghir_D05G039100、Ghir_D05G039110和Ghir_D05G039130为可能控制棉花黄萎病抗性的候选基因.[结论]在不同环境中共检测到 7 个抗黄萎病QTL,其中 4 个QTL被重复检测到,在主效QTL qVW-D05-1区间内筛选获得 5 个棉花抗黄萎病候选基因.这些稳定的抗黄萎病相关的QTL及其候选基因可应用于棉花抗黄萎病性状的分子标记辅助选择育种.

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