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烟草SRS基因家族鉴定与非生物胁迫诱导表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 杨亚仑;邓智超;董若男;潘晓璐;吴荣荣;刘涛;高晓明

作者机构:

关键词: 烟草;SRS基因家族;非生物胁迫;表达模式分析

期刊名称:中国烟草科学

ISSN: 1007-5119

年卷期: 2025 年 2 期

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收录情况: 北大核心(2023版) ; ; CSCD(2025-2026年度) ; ; 科技核心(2024版) ; ; 农林核心(2024版)

摘要: 短节间相关序列(SHI-related sequence,SRS)基因家族编码一类植物特有的锌指蛋白转录因子,在调节植物生长发育和响应逆境胁迫中发挥重要作用.为探究烟草SRS基因家族功能,本研究从烟草基因组数据库中鉴定了 18个NtSRS基因,命名为NtSRS1~NtSRS18.利用生物信息学方法,分析了该家族基因的蛋白质特征、亚细胞定位、系统进化关系、基因结构、启动子结构及其组织表达模式和对干旱、盐、低温胁迫的响应模式.结果表明:NtSRS蛋白都含有DUF702保守结构域,大部分NtSRS蛋白定位于细胞核上.NtSRS基因家族聚类为 5个亚家族,且同一亚家族成员的基因和蛋白质结构均具有较高的保守性;启动子结构分析表明,NtSRS基因家族成员的启动子区存在大量激素和逆境响应元件.NtSRS基因在不同组织器官中的表达量存在较大差异,大多数基因主要在花芽和茎中表达.NtSRS3和NtSRS16基因对干旱、盐和低温胁迫都有响应.本研究为烟草SRS基因家族的生物学功能研究奠定了基础,为烟草种质资源改良提供了理论依据.

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