数字农科院2.0

五指山猪MHCⅡ类分子基因鉴定与分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘园园;辛文水;晁哲;曹宗喜;蔡艺菲;李强;李凌伟;刘光亮

作者机构：

关键词： 五指山猪;主要组织相容性复合体;生物信息学;基因序列

期刊名称：实验动物与比较医学

ISSN： 1674-5817

年卷期： 2025 年 45 卷 3 期

页码：

收录情况： 科技核心（2024版）

摘要： 目的获得五指山猪主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)Ⅱ类分子基因序列,并分析其遗传信息,探究五指山猪MHC的生物学功能。方法采集3头成年雄性五指山猪的脾脏样本,根据MHCⅡ类分子基因序列设计引物,采用RT-PCR法扩增五指山猪MHCⅡ类分子基因的编码序列,通过Sanger测序确定MHCⅡ类分子基因序列,利用生物信息学软件分析五指山猪MHCⅡ类分子基因的理化性质、系统进化关系、保守基序和结构域,以及染色体位置和共线性关系。结果共鉴定出8个五指山猪MHCⅡ类分子基因,分别为SLA-DRA、SLA-DQA、SLA-DQB、SLA-DRB、SLA-DOB、SLA-DMB、SLA-DMA和SLA-DOA。Sanger测序后确定MHCⅡ类分子基因序列,并将序列上传至GenBank获得登录号,分别为PQ182796、PQ182797、PQ182798、PQ182799、PQ182800、PQ182801、PQ182802和PQ164779。系统进化树分析表明,五指山猪6个MHCⅡ类分子基因与杜洛克猪、梅山猪、大白猪和巴马猪等不同品种猪的MHCⅡ类分子基因不在同一个分支上。生物信息学分析表明,MHCⅡ类分子大部分为疏水性蛋白,其相对分子质量为27700~30000,归于同一亚区的基因含有相似的保守基序,其中SLA-DQB、SLA-DRB、SLA-DOB和SLA-DMB基因编码的4个MHCⅡ类分子包含MHCⅡβ保守结构域,SLA-DRA、SLA-DQA、SLA-DMA和SLA-DOA基因编码的4个MHCⅡ类分子包含MHCⅡɑ保守结构域。8个MHCⅡ类分子基因散在分布于五指山猪的7号染色体长臂上,与人的3个基因之间具有共线性关系,而与杜洛克猪的5个基因之间呈现共线性关系。结论五指山猪的MHCⅡ类分子基因可能具有特殊的遗传学起源。

分类号：

  • 相关文献

[1]五指山猪MHC II类分子基因鉴定与分析. 刘园园,辛文水,晁哲,曹宗喜,蔡艺菲,李强,李凌伟,刘光亮. 2024

[2]马MHC-I基因研究进展及其多态性分析方法探讨. 马建,项伟,吴俊明,华育平,周建华. 2011

[3]鸭不同MHC单倍型对禽流感重组疫苗免疫效果的影响. 赵丽丽,杨超,张晓娜,廉传江,文辉强,柳金雄,陈洪岩,陈化兰,韩凌霞. 2014

[4]鸡主要组织相容性复合体的结构与功能研究进展. 侯艳霞,王靖飞. 2010

[5]普氏野马与两种新疆地方品种马的ELA-DRA*exon2的多态性分析. 于丽娟,恩特马克,凌英会,马月辉,马合木提·哈力克. 2011

[6]鹿科动物主要组织相容性复合体(MHC)的研究进展. 孙红梅,丛波,邢秀梅,吴琼,刘伟. 2006

[7]小尾寒羊β2微球蛋白的表达及其二级结构预测分析. 王战红,赵志荀,吴国华,朱学亮,黄彩云,祁斌亮,赵芳燕,张志东,张强. 2020

[8]广西巴马小型猪白细胞抗原经典Ⅱ类基因克隆及生物信息学分析. 刘子展,王在贵,李奎,郭亚芬,王爱德,张玉琼,杨述林. 2012

[9]MHC Ⅰ分子与交叉递呈机制的研究与应用进展. 刘森,韦少强,张世栋. 2024

[10]五指山猪的泌乳性能及泌乳行为. 艾琴,杨红军,顾宪红. 2007

[11]转Bt玉米对生长期五指山猪血清生化指标及相关酶含量的影响. 刘圈炜,谭树义,孙哲,张宏福,杨晓光. 2013

[12]中国地方猪种obese基因遗传多样性研究. 姚娜,赵倩君,关伟军,马月辉. 2010

[13]转Bt玉米对生长期五指山猪生长性能及器官指数的影响. 孙哲,刘圈炜,谭树义,杨晓光,张宏福. 2013

[14]近交系五指山猪群体中DRA和DRB等位基因的SSCP检测及新等位基因的发现. 孙俊丽,冯书堂. 2005

[15]小型猪近交系新品种的培育与开发利用. 冯书堂,李奎,刘岚,高倩,程英,牟玉莲. 2015

[16]小型猪品系五指山猪(WZSP)的研究进展. 张青峰,冯书堂. 2007

[17]五指山猪GH、IGFBP3基因SNPs检测及与生长性状的关联分析. 侯冠彧,曾鸿普,周汉林,王东劲,管松,马月辉. 2010

[18]亚慢性镉暴露对五指山猪肝脏生化指标的影响. 吴小胜,魏帅,魏益民,郭波莉,杨鸣琦,刘晓玲. 2012

[19]五指山猪(WZSP)近交系生长曲线分析与拟合研究. 张青峰,冯书堂,牟玉莲,张勇,王钦德. 2006

[20]亚慢性镉暴露致五指山猪肾脏脂质过氧化损伤. 吴小胜,魏帅,杨鸣琦,魏益民,郭波莉. 2013

作者其他论文 更多>>