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利用水稻耐盐品种 Pokkali 衍生材料选育的高产耐 盐新种质的遗传变异

文献类型： 中文期刊

关键词： 水稻;;新种质;;耐盐性;;高产;;变异位点;;基因聚合

期刊名称：中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2025 年

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收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2025-2026年度） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2024版）

摘要： 摘要：【目的】以耐盐品种 Pokkali 衍生材料 Pokkali-D（Pokkali-Dwarf）为父本，以高产优质品种华占为母本，获得中盐 稻 16，通过分析中盐稻 16 的基因组，鉴定高产耐盐的关键变异位点和基因，为水稻耐盐分子育种提供理论依据和基因资源。 【方法】通过对耐盐亲本 Pokkali-D 和高产亲本华占进行杂交育种，创制出兼具耐盐性和高产特性的新种质中盐稻 16。检 测盐胁迫下中盐稻 16 幼苗的存活率和成熟期产量，鉴定中盐稻 16 的耐盐性。利用重测序技术对 Pokkali-D、华占和中盐稻 16 进行全基因组测序，通过变异检测筛选出中盐稻 16 来自两亲本的关键变异位点和特有的变异位点。并针对高影响效应位 点（变异导致翻译读码框移码或提前终止）和中等影响效应位点（变异导致氨基酸突变）进行基因注释。【结果】在 120 mmol·L-1 NaCl 处理下，中盐稻 16 的苗期存活率与 Pokkali-D 相当，且显著高于华占；正常大田条件下，中盐稻 16 的产量与华占相 当，而显著高于 Pokkali-D；在 0.4%盐浓度条件下，中盐稻 16 的产量显著高于两亲本，表现出高产与耐盐性协同改良优异 性状。与日本晴参考基因组比较分析发现，中盐稻 16 与华占共有 86 716 个相同变异位点，高影响和中等影响效应位点注释 到 1 629 个基因；中盐稻 16 与 Pokkali-D 共有 21 623 个相同变异位点，高影响和中等影响效应位点注释到 443 个基因；中盐 稻 16 特有变异位点 372 个，高影响和中等影响效应位点注释到 11 个基因。对上述 2 083 个基因进行功能检索，发现明确具有 耐盐调控功能的基因有 16 个，其中 12 个来自华占，4 个来自 Pokkali-D；与产量性状相关的基因有 48 个，36 个来自华占，12 个来自 Pokkali-D；同时具有产量和耐盐性调控功能的基因有 3 个，其中 2 个来自华占，1 个来自 Pokkali-D。值得注意的是， 来自 Pokkali-D 的 OsPRPL18、OsSTLK、STH1、OsLPR2 和 OsLPR5 耐盐等位基因与来自华占的 OsSAP4、OsY3IP1、OsABI5 和 OsHKT1; 5 等耐盐等位基因在中盐稻 16 中发生聚合。【结论】中盐稻 16 通过聚合华占和 Pokkali-D 的产量与耐盐性调控基因，兼具了丰 产性和耐盐性，耐盐品种 Pokkali-D 中的耐盐等位基因在华占中进一步聚合后可以提高耐盐性，但对产量无影响。

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