文献类型： 中文期刊
作者： 蒙泽菁;房永祥;贾怀杰;高真贞;陈国华;何小兵;景志忠;王晓霞
作者机构：
关键词： 羊口疮病毒;基因克隆;亚细胞定位;生物信息学
期刊名称：中国病原生物学杂志
ISSN： 1673-5234
年卷期： 2023 年 18 卷 02 期
页码：
收录情况： 北大核心（2020版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2023版）
摘要： 目的 克隆羊口疮病毒020基因，构建其重组真核表达质粒并转染HeLa细胞，分析020基因编码E3L蛋白的亚细胞定位，分析该蛋白生物信息学特征。方法 提取羊口疮病毒基因组，PCR扩增020基因并构建重组真核表达质粒，转染HeLa细胞，采用Western blot检测其在该细胞中的表达，免疫荧光法检测该蛋白的亚细胞定位。利用DNAstar软件分析不同毒株ORFV E3L氨基酸序列特点及其遗传演化关系；利用SOMPA软件分析其二级结构；利用SignalP4.0软件预测信号肽；利用TMHMM2.0软件预测跨膜结构；利用NetPhos 3.1预测磷酸化位点；利用NetNGlyc-1.0预测糖基化位点；应用IDEB和SYFPEITHI预测ORFV E3L蛋白的抗原表位。结果 成功克隆得到ORFV 020基因，全长549 bp,编码183个氨基酸；亚细胞定位显示该蛋白定位于细胞核和细胞质。生物信息学分析ORFV E3L蛋白α螺旋约占40.44%、β折叠约占5.46%、延伸链约占16.94%、无规则卷曲约占37.16%;该蛋白无信号肽和跨膜结构，可能存在15个磷酸化位点，7个N-糖基化位点，5个B细胞线性表位，2个CTL表位，3个Th细胞表位，3个B细胞和CTL联合表位，3个B细胞和Th细胞联合表位。结论 ORFV E3L蛋白定位于细胞核和细胞质，含有多个抗原表位，可能具有免疫原性。该蛋白高度保守，具有成为优势保护性抗原的潜力。为进一步揭示ORFV E3L蛋白的功能奠定基础，为ORFV诊断方法的建立及疫苗的研制提供了理论依据。
分类号：
- 相关文献
[1]羊口疮病毒ORF125基因编码蛋白的结构预测及其在真核表达质粒转染细胞中的定位. 孔汉金,张克山,刘永杰,尚佑军,刘湘涛,吴斌. 2014
[2]林烟草KUP/HAK/KT钾转运体基因NsHAK11的亚细胞定位与表达. 宋毓峰,董连红,靳义荣,史素娟,张良. 2014
[3]菜豆ANK基因家族鉴定及ANK25的表达模式分析. 张婷,张双喜,裴丽丽,于太飞,陈明,李连城,周永斌,马有志,徐强. 2014
[4]人参PgWRKY22基因的克隆及在磷胁迫下的表达分析. 梁浩,孙海,邵财,钱佳奇,张亚玉. 2023
[5]小麦中果聚糖合成酶基因与抗旱性关系及其分子生物学研究. 叶兴国,高翔,佘茂云,殷桂香,乔卫华,徐惠君,杜丽璞,王瑾,陶丽莉. 2009
[6]玉米ZmCLCa基因克隆及其对氮素吸收的功能验证. 曾廷儒,张静,张登峰,杜金友. 2016
[7]中间锦鸡儿DHN1基因克隆及表达分析. 万永青,杨洋,张春林,万东莉,杨爱琴,杨杞,王瑞刚,李国婧. 2016
[8]拟南芥活性氧响应基因GDI功能初步分析. 刘凌云,孟飒飒. 2013
[9]东方山羊豆Cu/ZnSOD基因的克隆及表达分析. 李玉坤,王学敏,高洪文,仁爱琴,王赞,孙桂枝. 2012
[10]玉米ZmCLCa基因克隆及其对氮素吸收的功能验证. 曾廷儒,张静,张登峰,杜金友. 2017
[11]小麦TaARF20基因克隆及表达分析. 郭晓凤,王超杰,张莉莉,景豆豆,李政,都晶晶,马守才. 2021
[12]小麦矮腥黑粉菌g9890基因编码效应蛋白的生物信息学分析及亚细胞定位. 许停,刘太国,高利,陈万权. 2023
[13]小麦矮腥黑粉菌g1070基因的克隆、生物信息学分析与亚细胞定位. 金泽鑫,刘琦,高利. 2023
[14]水稻雌雄不育突变体Osfma2的细胞学观察及基因图位克隆. 张涛荟,王海宇,万华,张莉萍,谢振威,陈可毅,何晓栋,赵志刚,万建民. 2022
[15]猫源C11orf96基因表达及其在细胞中的定位分析. 杨洪早,朱杰,郭宏元,汤傲星,陈少宇,刘春草,张达,袁莉刚,刘光清. 2022
[16]陆地棉GhWOX4转录因子的克隆与生物信息学分析. 杨卫军,吕有军,赵兰杰,张永山. 2018
[17]海岛棉GbHCT基因克隆及生物信息学分析. 崔雪,加得拉·吐留汗,于月华,陈全家,申丽婕,叶佳丽,杨飓立,陶顺,倪志勇. 2016
[18]牛带绦虫8ku蛋白基因家族cDNA的克隆和序列分析. 王玉朝,贾万忠,闫鸿斌,郭爱疆,岳城. 2010
[19]猪T细胞受体α链基因的克隆、序列分析及其结构预测. 冯海燕,莫斯科,房永祥,景志忠. 2010
[20]猪T细胞受体γ链基因的克隆及生物信息学分析. 李玩生,房永祥,曾爽,景志忠. 2010
作者其他论文 更多>>
-
安第斯病毒研究进展
作者：贺安文;景志忠;何小兵;翟军军;张艳
关键词：安第斯病毒(Andes virus;ANDV);病原学;流行病学;防治
-
甘肃省兰州地区猫传染性腹膜炎临床诊疗现状的调查与分析
作者：宋世斌;李玩生;陈国华;李亚兰;朱永军
关键词：猫传染性腹膜炎;统计与分析;诊断;治疗
-
近交系合作小型猪遗传多样性的微卫星标记分析
作者：杨帆;宋世斌;何小兵;管齐赛;陈国华;贾怀杰;高真贞;赵波;李政厅;房永祥;景志忠
关键词：近交系合作;小型猪;微卫星DNA;遗传多样性;实验动物化培育
-
瓜实蝇和南亚实蝇的产卵特性比较
作者：胡英;李貌;韦晓曼;李娟;杨云芳;张金龙;陈国华;周忠实;张晓明
关键词：瓜实蝇;南亚实蝇;产卵期;产卵量;种间竞争
-
猴痘病毒gp085蛋白生物信息学分析及其多克隆抗体制备
作者：张亚岭;王振蕊;景伟;苏洋;陈国华;何小兵;房永祥;李小明;景志忠;曾巧英
关键词：猴痘病毒;gp085蛋白;生物信息学分析;原核表达;多克隆抗体
-
詹姆斯敦峡谷病毒研究进展
作者：赵娜;景志忠;张艳;翟军军
关键词：詹姆斯敦峡谷病毒;病原生物学;流行病学;诊断;预防与控制
-
牛结节性皮肤病病毒基因组及其功能研究进展
作者：潘玉平;邓瑞雪;胡小慧;贾怀杰;安芳兰;刘学荣
关键词：牛结节皮肤病病毒;基因组;功能