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一起东北黑熊死亡病例的病毒宏基因组学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 孙政;张如;涂长春;杨艳玲;何彪

作者机构：

关键词： 东北黑熊;细菌检测;病毒宏基因组;细小病毒

期刊名称：病毒学报

ISSN： 1000-8721

年卷期： 2024 年

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2024版）

摘要： 黑熊是我国重要的野生动物资源，保护黑熊是我国野生动物保护的重要内容之一。本研究使用常规细菌检测和病毒组学分析，对一起黑熊死亡案例进行病原分析。细菌学检测发现了肠出血性大肠杆菌和A型魏氏梭菌阳性，但结合临床症状，排除了细菌感染的可能。随后使用RNA和DNA病毒组技术相结合，对其进行全病毒组分析，结果发现了Parvovirus、Anellovirus、Circovirus等7个病毒信息，其中肾脏携带的病毒最为丰富，有7个科。在这些病毒中，Parvovirus、Anellovirus和Circovirus与已知病毒核苷酸同源性小于90%，而其余病毒与当前已知病毒同源性高达99%。绝大多数病毒致病性不明确，值得注意的是本研究发现的细小病毒在黑熊中呈现系统感染，且与美国的一株熊细小病毒NS1氨基酸同源性为86.8%，但其与此次黑熊死亡的关联需进一步研究。本研究首次用病毒组技术对黑熊样本病毒组进行分析，结果虽不能判定此次黑熊死亡的原因，但相关数据为了解黑熊病毒多样性提供了重要的基础数据。

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