数字农科院2.0

植物基因组组装技术研究进展

文献类型： 中文期刊

作者： 唐蝶;;周倩

作者机构：

关键词： 植物基因组;基因组组装;高通量测序;生物信息学

期刊名称：生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2021 年 37.0 卷 6.0 期

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; CSCD（2020-2021年度） ; 农林核心（2020版） ; 科技核心（2020版）

摘要： 获得包含基因组全序列的参考基因组是对物种进行基因组学研究和利用的前提。大多数被子植物经历过全基因组复制或多倍化以及随后的染色体重排、丢失,很多植物还经历过重复序列大规模扩张,导致了基因组大小的剧烈膨胀,这些事件塑造了植物基因组复杂的特征和广泛的多样性,也在一定程度上导致了植物基因组组装的诸多难题。本文将植物基因组按照简单、高杂合、高重复、高倍性基因组和泛基因组进行分类,介绍不同类型的基因组适用的组装策略及应用效果,并对新测序技术在组装中的应用趋势进行展望。

分类号：

  • 相关文献

[1]植物基因组表达序列标签(EST)计划研究进展. 骆蒙,贾继增. 2001

[2]植物基因组表达序列标签（EST）计划研究进展. 骆蒙,贾继增. 2001

[3]假眼小绿叶蝉微卫星位点的生物信息学分析. 李倩,陈学新,韩宝瑜. 2016

[4]多房棘球蚴感染小鼠脾淋巴细胞中差异表达miRNA的鉴定及其生物信息学分析. 仲顺虎,孙玥,郭小腊,郑亚东,陈轶霞. 2022

[5]运用CRISPR/Cas系统对植物基因组进行定点编辑. 宋时奎,王影,于洋,耿立召,张春翔,李相敢,韩天富. 2014

[6]醋栗番茄染色体水平基因组组装. 刘志强,蔡和序,崔霞. 2022

[7]西藏拟南芥InDel分子标记开发与株高调控基因初步定位. 杨明康,陈楚敏,张会,黄巍,陈亮. 2022

[8]植物超泛基因组研究现状与展望. 黄小琴,胡丽松,范睿,张兴坦,郝朝运. 2025

[9]印加孔雀草对土壤细菌群落多样性的影响. 郓玲玲,张瑞海,宋振,付卫东,王然,王忠辉,张国良. 2020

[10]秸秆配施腐熟剂对土壤细菌群落及养分状况的影响. 黄玲,张自阳,赵若含,郭好娟,张璐瑶,李冰洁,卢奎,武忠伟. 2019

[11]孔雀石绿降解菌群多样性及高效降解菌的降解特性分析. 王亚妮,宋金龙,韩刚,穆迎春,江旭,王金耀,阮志勇,李乐. 2019

[12]龟纹瓢虫幼虫体内主要共生菌种类分析. 吴林珂,张帅,雒珺瑜,张利娟,吕丽敏,朱香镇,王丽,崔金杰. 2018

[13]基于转录组数据的印度谷螟微卫星位点分析. 唐培安,陶冶心,薛昊,袁明龙. 2017

[14]利用亚硝基胍诱变和高通量测序技术分析疯草内生真菌产SW生物合成通路. 郝宝成,宋向东,高艳,王学红,刘宇,陈柯源,梁妍,胡毓瑶,邢小勇,温峰琴,胡永浩,梁剑平. 2019

[15]贵紫麦1号籽粒色素形成相关基因的差异表达. 徐熙,任明见,李鲁华,杨喜翠,徐如宏. 2018

[16]贝加尔针茅草原土壤真菌群落结构对氮素和水分添加的响应. 张海芳,刘红梅,赵建宁,李刚,赖欣,李洁,王慧,杨殿林. 2018

[17]不同再生水灌溉方式对土壤-辣椒系统中细菌群落多样性及病原菌丰度的影响. 崔丙健,高峰,胡超,李中阳,樊向阳,崔二苹. 2019

[18]典型煤层水微生物产甲烷潜力及其群落结构研究. 来守超,方晓瑜,涂波,陈浩,邓泽,李贵中,陈振宏,张辉,承磊. 2020

[19]新疆泥火山微生物群落. 覃千山,承磊,张辉,胡国全. 2015

[20]不同土壤玉米根际挥发性有机物组成和微生物群落特征. 李艳玲,宋阿琳,卢玉秋,王恩召,唐治喜,刘雄舵,范分良. 2019

作者其他论文 更多>>