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基于SSR标记的海南54份榴莲种质资源遗传多样性和群体结构分析

文献类型： 中文期刊

作者： 邓会栋;乔阳;郭利军;华敏;谢圣华;冀晓昊;吴晓慧;冯学杰;王海波

作者机构：

关键词： 榴莲种质资源;荧光SSR标记;聚类分析;群体结构;遗传多样性;遗传分化

期刊名称：中国果树

ISSN： 1000-8047

年卷期： 2023 年 12 期

页码：

收录情况： 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 对海南省引种种植的54份榴莲种质资源采用荧光SSR分子标记技术,进行SSR多态性分析、聚类分析、群体结构分析、遗传多样性分析.结果表明,筛选获得19对多态性较高的SSR引物,通过DNA扩增共检测出117个多态性等位基因,平均多态性等位基因数为6.158个,平均有效等位基因数为3.398个,香农指数平均值为1.372,观察杂合度和期望杂合度的平均值均为0.689,多态信息指数平均值为0.643,表明具有一定的遗传多样性.基于UPGMA方法进行聚类分析,在遗传距离0.6处54份榴莲种质资源可以分成3个类群,第一类群共45份种质资源,包括引种于不同国家的不同榴莲品种;第二类群共8份种质资源,均为引种于不同国家的猫山王榴莲;第三类群共1份种质资源,是引种于泰国的红榴莲.以遗传距离0.3为阈值,第一类群又可以分为9个亚群.基于Structure可以将54份榴莲种质资源划分为5个亚群.综合聚类和群体结构分析,明确了部分未知种质资源的品种所属,对不同亚群的遗传变异、遗传距离和遗传分化分析发现,个体的变异是总变异的主要来源,亚群5与其他亚群的遗传距离和遗传分化程度最大,不同亚群整体基因流较大,遗传分化程度较低.

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