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人参PgSL基因的克隆及表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 梁浩;孙海;邵财;周季欣;吕柏辰;朱家鹏;张亚玉

作者机构：

关键词： 人参;独脚金内酯;氮和磷;基因表达分析

期刊名称：中药材

ISSN： 1001-4454

年卷期： 2024 年 06 期

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; 科技核心（2024版）

摘要： 目的:克隆人参Panax ginseng独脚金内酯酶基因Pg SL并进行生物信息学分析,确定Pg SL基因在缺氮、缺磷及独脚金内酯类似物GR24处理下的表达水平。方法:根据高通量测序获得人参Pg SL基因CDS序列,利用同源重组和golden gate无缝克隆的方法,扩增Pg SL基因CDS序列,并将其编码的氨基酸序列提交至NCBI、Protparam、SOPMA等网站和软件进行生物信息学分析;利用荧光定量PCR(qRT-PCR)检测缺氮、缺磷及外源GR24处理下人参根部组织中Pg SL基因的表达水平。结果:人参Pg SL基因的CDS序列为816 bp,编码271个氨基酸;PgSL蛋白属于MhpC家族蛋白,该蛋白相对稳定,属于疏水性蛋白,α螺旋为主要组成部分;PgSL蛋白与琐氏独活Heracleum sosnowskyi、核桃树Juglans regia、木本棉Gossypium arboreum中的独脚金内酯酶具有较近的系统发育关系;与对照组相比,缺氮处理下Pg SL基因的表达量升高,当施用外源GR24后,Pg SL基因的表达量降低;缺磷处理下Pg SL基因的表达量无显著变化,当施用外源GR24后,Pg SL基因的表达量上升;同时缺氮缺磷处理下Pg SL基因的表达量降低,当施用外源GR24后,Pg SL基因的表达量升高。结论:克隆获得Pg SL基因的CDS序列及表达信息,可为后续进行基因功能研究和人参栽培的氮磷营养调控提供参考。

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