数字农科院2.0

深度学习在植物基因组学与作物育种中的应用现状与展望

文献类型： 中文期刊

作者： 侯祥英;崔运鹏;刘娟

作者机构：

关键词： 植物基因组学;作物育种;深度学习;图深度学习;综述

期刊名称：农业图书情报学报

ISSN： 1002-1248

年卷期： 2022 年

页码：

收录情况： 农林核心（2020版）

摘要： [目的/意义]随着单细胞测序、高通量技术的突破,植物基因组学也取得了巨大进步,可以低成本获取多维全基因组分子表型的海量数据。深度学习技术可以作为强大的数据挖掘工具对获取的分子表型进行进一步预测和解释。当前研究表明,深度学习在植物基因组学与作物育种研究任务中取得显著效果。但目前尚缺乏对于深度学习在植物基因组学中应用的完整综述。[方法/过程]本文首先概述了深度学习方法背景,包括最新的图神经网络;;随后着重从基因特性、蛋白质特性方面综述了基因组学和深度学习交叉领域的两个突出问题:1)如何对从植物基因组DNA序列到分子表型的信息流进行建模;;2)如何使用深度学习模型识别自然种群中的功能变异?[结果/结论]本文总结了当前研究中如何应用传统深度学习算法、图深度学习、生成对抗网络以及可解释性AI等方法解决上述两个问题。最后分析了深度学习在未来植物基因组学研究和作物遗传改良中的发展前景。

分类号：

  • 相关文献

[1]植物复杂基因组与泛基因组研究现状与展望. 王英豪,余嘉鑫,唐海宝,张兴坦. 2023

[2]植物超泛基因组研究现状与展望. 黄小琴,胡丽松,范睿,张兴坦,郝朝运. 2025

[3]Study on Recognition of Typical Curing Stages of Jiangxi Tobacco Leaves Based on Image Processing. 段史江,,刘浩,,王爱华,,胡毅翀,,齐飞,,胡强. 2024

[4]Study on Discriminant Model of Flue-curing Stage of Tobacco Leaves in Curing Process. 王志诚,,孟令峰,,王松峰,,谢良文,,李文刚. 2024

[5]1960～2004年中国农作物新品种选育数量及其分布特点研究. 陆建中,付长亮. 2008

[6]高屋建瓴脚踏实地——向王金陵教授学习;祝贺王金陵教授九十华诞. 常汝镇,邱丽娟,李文滨,韩天富,李新海. 2006

[7]作物基因组学与作物科学革命. 贾继增,高丽锋,赵光耀,周文斌,张卫健. 2015

[8]利用花药相关基因及启动子创制雄性不育种质研究进展. 杨晓杰,房卫平,谢德意,周小玲,赵元明,赵付安,唐中杰,李付广. 2011

[9]作物育种试验区机械化的研究进展. 卢秉福,胡志超,张祖立. 2006

[10]苗期标记性状在我国作物育种及种子纯度鉴定上的研究应用进展. 马双武. 2011

[11]作物低植酸育种研究进展. 赵建军,许泽永,方小平. 2003

[12]油菜素内酯参与调控植物生长发育与抗逆性的机制及其育种应用研究. 曹清河. 2015

[13]CodeFinder,一个用于育种系谱信息查找的Excel宏. 刘红艳. 2007

[14]关于我国农业科技创新体系建设几个问题的思考. 张世煌. 2012

[15]基因组编辑技术应用于作物遗传改良的进展与挑战. 王福军,赵开军. 2018

[16]除草剂抗性农作物育种研究进展. 李燕敏,祁显涛,刘昌林,刘方,谢传晓. 2017

[17]CodeFinder;一个用于育种系谱信息查找的Excel宏. 刘红艳. 2007

[18]利用花药相关基因及启动子创制雄性不育种质进展. 杨晓杰,赵付安,谢德意,赵元明,唐中杰,李付广,房卫平. 2011

[19]同源转基因将成为利用野生资源进行作物育种的一种有效手段. 黄三文,杜永臣,屈冬玉,Evert Jacobsen. 2006

[20]营养导向型作物新品种选育与审定现状、问题与展望. 朱大洲,武宁,张勇,孙君茂,陈萌山. 2022

作者其他论文 更多>>