野生大麦SOD基因家族生物信息学分析
文献类型: 中文期刊
作者: 高诚;林一欣;饶江雷;覃英;邓志军
作者机构:
关键词: 野生大麦;超氧化物歧化酶;基因家族;系统发育分析;基因表达
期刊名称:湖北民族大学学报(自然科学版)
ISSN: 2096-7594
年卷期: 2025 年 自然科学版 期
页码:
收录情况: 无来源刊(2025版)
摘要: 为了探究野生大麦(Hordeum vulgare ssp.spontaneum(K.Koch) Thell.)的抗逆潜力,通过生物信息学方法对其超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)基因家族进行了全基因组水平的鉴定与分析。结果表明,野生大麦SOD基因家族共有10个成员,分属B1KCSD、B1KMSD、B1KFSD 3个亚家族,分别有7、1、2个成员,不均匀分布在5条染色体上,与大麦相比增加了HorvuFT113H01G447400、HorvuFT115H01G364600、HorvuFT115H01G368700SOD基因。蛋白结构分析结果显示,野生大麦的SOD蛋白家族主要以无规则卷曲为主;同一蛋白亚家族成员的蛋白保守基序组成相似,在进化上相对保守,但基因结构差异较大。基因表达分析表明,在盐胁迫下,B1K CSD1、B1K CSD2、B1KC...
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