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棉花HKT基因家族生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 孙亮庆;聂太礼;赵兰杰;王俊娟;王帅;王德龙;陆许可;陈修贵;陈超;叶武威

作者机构：

关键词： 棉花;HKT;生物信息学

期刊名称：分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2022 年

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; 科技核心（2021版） ; 农林核心（2020版）

摘要： 高亲和性钾离子转运蛋白(high affinity K+ transporter， HKT)是存在植物中的离子转运体，主要负责Na+/K+协调运输，在响应植物逆境胁迫中发挥重要的作用。本研究利用生物信息学方法鉴定了陆地棉（G.hirsutum）、海岛棉（G.barbadense）、雷蒙德氏棉（G.raimondii）、亚洲棉（G.arboreum）的HKT基因家族成员，解析了HKT基因家族成员的理化性质、序列特征、亚细胞定位、跨膜结构、Motif组成，系统分析了棉花HKT基因家族的分类、系统进化树、顺式作用元件等。结果显示，棉花中共有11个HKT基因家族成员，编码的11个HKT蛋白定位到了质膜上，均具有9个跨膜螺旋区；棉花11个HKT基因家族成员可以分为2组，亲缘关系较近的HKT基因家族成员编码的HKT蛋白比较类似的Motif类型和顺式作用元件。HKT基因家族具有组织特异性表达特点。通过对HKT基因家族成员的生物学分析，为进一步探索棉花HKT基因响应盐碱胁迫的功能研究提供了参考依据。

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