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富营养饮食重塑代谢性疾病易感猪关键组织mRNA剪接模式研究

文献类型： 中文期刊

作者： 夏博策;张凯艺;苗佳坤;彭焕祺;杨宇;陶聪;吴添文;王彦芳;杨述林

作者机构：

关键词： 富营养饮食;代谢性脂肪性肝病;代谢性疾病易感猪;可变剪接;剪接因子

期刊名称：畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2022 年

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; CSCD（2021-2022年度） ; 科技核心（2021版） ; 农林核心（2020版）

摘要： 旨在探讨富营养饮食对代谢性疾病易感猪关键组织可变剪接（alternative splicing，AS）和剪接因子（splicing factors，SFs）的影响。本研究以健康状态、月龄和体重相同的12头代谢性疾病易感公猪为材料，随机将其分为两组，其中8头猪饲喂高脂高能量饲料2个月作为富营养饮食组（TG-HFHSD），4头猪饲喂正常饲料2个月作为对照饮食组（TG-CD）。对TG-HFHSD和TG-CD的脂肪、肝、肌肉和下丘脑组织进行RNA-seq测序，利用rMATS软件鉴定组间差异AS，对差异剪接基因（differential splicing genes，DSGs）进行GO和KEGG富集分析，并利用DESeq2软件和皮尔逊相关性系数分析肝脏组织中的SFs。结果显示，脂肪、肝、肌肉和下丘脑中分别鉴定到48 279、39 536、47 888和52 210个AS事件，均以SE类型为主，占比在77.09%～78.29%之间。脂肪、肝、肌肉和下丘脑中的DSGs数分别为528、1 070、570和600个，其中肝脏增加的DSGs部分主要是RI和MXE两种类型，分别为177和471个，而其它组织仅为12～28个和99～110个。GO和KEGG富集显示，肝除富集到细胞结构相关的过程外，还显著富集到可变剪接及mRNA代谢、脂质代谢、DNA损伤及修复、补体与凝血级联等过程。肝中筛选到56个差异表达的SFs，其中CLK1、PGC-1ɑ、USP4等与糖脂代谢和代谢性疾病有密切关系。本研究表明，富营养饮食显著增加肝DSGs，通过剪接调控、糖脂代谢以及DNA损伤来影响肝代谢性疾病的发生，将为肝代谢性疾病早期发生机制研究提供参考。

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