数字农科院2.0

美仁牦牛Akirin1基因克隆及在不同组织中的表达研究

文献类型： 中文期刊

作者： 马小勇;杨国武;杨树猛;丁考仁青;唐月琴;赵雪;张艳丽;梁春年

作者机构：

关键词： 美仁牦牛;Akirin1;成肌细胞;基因克隆;实时荧光定量PCR

期刊名称：甘肃农业大学学报

ISSN： 1003-4315

年卷期： 2023 年

页码：

收录情况： CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2023版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 【目的】Akirin1基因是调控成肌细胞分化的关键基因，克隆美仁牦牛Akirin1基因编码区（CDS）序列进行生物信息学分析，并检测该基因在各组织间的表达特征，为研究调控牦牛肌肉生长的基因功能提供理论依据。【方法】利用RT-PCR技术克隆美仁牦牛Akirin1基因CDS区序列，通过生物信息学软件分析蛋白理化性质和结构，预测蛋白信号肽和磷酸化位点及构建系统进化树；通过qPCR 技术检测Akirin1基因在美仁牦牛成年牛各组织间及胎牛肌肉中mRNA 的表达水平。【结果】结果表明，美仁牦牛Akirin1基因CDS区全长579 bp，编192个氨基酸，蛋白相对分子质量为21879.86 Da，理论等电点8.91，总平均亲水性-0.822，为亲水性蛋白；系统进化树表明美仁牦牛与普通牛和印度水牛亲缘关系最近，同源性分别为100%、98.44%；Akirin1蛋白有29处磷酸化位点，无信号肽和跨膜区，主要在细胞核中发挥生物学功能；美仁牦牛Akirin1蛋白主要是由α-螺旋和无规则卷曲组成。Akirin1基因在美仁牦牛脂肪组织中表达量最高，与其它组织比较差异显著（P＜0.05），且肌肉和心脏组织中的表达量最低；胎牛背最长肌中Akirin1基因表达量显著高于成年牛（P＜0.05）。【结论】对克隆出的美仁牦牛Akirin1 基因CDS 区进行生信分析发现该基因编码192个氨基酸，Akirin1蛋白为亲水性蛋白，无跨膜结构域，美仁牦牛Akirin1 基因与普通牛和印度水牛分别为100%和98.44%，表明该基因高度保守；Akirin1基因在美仁牦牛不同组织中的表达差异显著，且在胎牛背最长肌中的表达量高于成年牛，推测该基因的表达在牦牛早期的生长发育阶段发挥了重要作用。

分类号：

  • 相关文献

[1]美仁牦牛PDK4基因克隆及组织表达. 马小勇,戴荣凤,李歆怡,杨国武,扎老,路建卫,赵雪,梁春年. 2023

[2]牦牛FABP3基因克隆及组织表达谱分析. 戴荣凤,黄纯,扎老,路建卫,唐月琴,梁春年. 2024

[3]桑树MaGH3.6基因的克隆与诱导表达及时间特异性. 张晓峰,焦锋,聂浩,刘明鲁,程嘉翎. 2013

[4]甜樱桃AGAMOUS_like的克隆及赤霉素处理下的表达分析. 林苗苗,陈锦永,顾红,齐秀娟,张威远,张洋,方金豹. 2014

[5]益生菌FGM葡萄糖激酶基因(glcK)在黄芪发酵中的表达. 郝桂娟,王龙,张凯,张景艳,王学智,孟嘉仁,杨志强,李建喜. 2013

[6]桑树翻译调控肿瘤蛋白(TCTP)基因的克隆及其在温度胁迫下的表达变化. 雷朋,何庆玲,贺芳,吴琼英,潘刚. 2015

[7]马铃薯甲虫热激蛋白基因Ld-HSP60的克隆、序列分析及温度胁迫下的表达. 魏长平,蒋健,李祥瑞,张云慧,张方梅,程登发,郭文超,刘怀. 2017

[8]蓖麻蚕AGO1蛋白基因的克隆及序列与表达特征. 何庆玲,张月华,钱荷英,罗旭芳,李刚. 2014

[9]东方山羊豆脱水蛋白基因的克隆及初步分析. 李玉坤,王学敏,王赞,李俊,Vladimir C,Nikolay D,孙桂枝,高洪文. 2012

[10]家蚕微孢子虫水通道蛋白基因NbAQP的克隆及表达特征分析. 王玮,陈功,彭祥然,李孝良,唐旭东. 2016

[11]东方山羊豆Cu/ZnSOD基因的克隆及表达分析. 李玉坤,王学敏,高洪文,仁爱琴,王赞,孙桂枝. 2012

[12]桑树肉桂酸-4-羟化酶基因(MmC4H)的克隆及在不同桑品种间的表达差异. 黄满芬,王恒,方荣俊,赵卫国,张林. 2014

[13]马铃薯甲虫热激蛋白基因Ld-hsp90的克隆及温度胁迫下的表达. 李祥瑞,张云慧,郭文超,程登发,郭青云. 2013

[14]小麦TaARF20基因克隆及表达分析. 郭晓凤,王超杰,张莉莉,景豆豆,李政,都晶晶,马守才. 2021

[15]鸡成肌细胞及不同品种肌肉组织的FAFFAF1 mRNA表达特征分析. 刘龙洲,梁忠,黄华云,黎寿丰,赵振华,李春苗,王钱保,黄正洋,吴姝. 2017

[16]腺苷甲硫氨酸对成肌细胞成脂分化及脂肪沉积的影响. 于渤洋,吕文涛,巨婷婷,刘洋,姜美华,尹靖东. 2012

[17]MYCN基因在鸡成肌细胞和胸肌组织表达及生长发育中变化. 崔小燕,汪芳杰,刘冉冉,郑麦青,文杰,付睿琦,姜润深,赵桂苹. 2015

[18]鸭胚胎期成肌细胞IGF-IR基因mRNA的表达与分析. 姬改革,陶志云,朱春红,刘宏祥,李慧芳. 2014

[19]乌珠穆沁羊成肌细胞的诱导分化及相关基因表达. 魏彩虹,王皓,杜立新,李发弟. 2012

[20]不同品种鸭胚胎期骨骼肌成肌细胞GHR和IGF-1 mRNA表达差异分析. 姬改革,陶志云,朱春红,束婧婷,刘宏祥,徐文娟,胡艳,李慧芳. 2016

作者其他论文 更多>>