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番茄重要性状HRM分子标记开发及不同反应体系的分析效果评价

文献类型： 中文期刊

作者： 刘畅;魏凯;章力;路菲菲;余庆同;王梦雅;王孝宣;杜永臣;国艳梅;李君明;刘磊;李鑫;朱璨;黄泽军

作者机构：

关键词： 番茄;重要性状;优异等位基因;HRM;分子标记

期刊名称：园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2025 年

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2025-2026年度） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2024版）

摘要： 高分辨率熔解曲线（high-resolution melting,HRM）分型技术可以通过形成不同的熔解曲线鉴定样品的基因型，具有操作简单、速度快、通量高、分辨率高等优点。为开发番茄重要性状优异等位基因的HRM分子标记和评估不同因素对HRM分析效果的影响。基于23个优异等位基因或其附近的序列特征，成功开发了23个HRM分子标记，分别用于检测23个重要性状基因位点。包括抗病基因Bwr-12、Frl、I-7、Pto、Rx4、Sm和Ty-1，耐非生物胁迫基因SlACR11A、SlBBX31、SlHAK20和SlSOS2，果实性状相关基因Aft、LC、GF、OVATE、PT、R、SlALMT9、STP1和Y，株型相关基因SD1、SP和SP5G。另外，通过评估不同反应体积、模板DNA浓度和DNA提取方法对HRM分析效果的影响，发现5、7.5、10、12.5和15μL的反应体积与试剂盒推荐的20μL反应体积具有相同的分析效果；在5μL反应体积下，DNA浓度在12.5～1 600 ng·μL-1的较宽范围内均具有良好的分析效果；NaOH法粗提的DNA也适用于HRM分析检测。本研究结果可应用于番茄优异等位基因鉴定及分子标记辅助育种中。

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