数字农科院2.0

鸭甲肝病毒GX株全基因组序列测定及VP1蛋白生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 黄云秀;李传峰;孟春春;陈宗艳;李露;宋凯杰;刘光清;韦天超

作者机构：

关键词： 鸭甲肝病毒;全基因组;序列分析;VP1蛋白;B细胞抗原表位

期刊名称：中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2015 年 42 卷 05 期

页码： 1039-1047

收录情况： 北大核心

摘要： 为探讨鸭甲肝病毒(DHAV)GX株基因分型特点及主要衣壳蛋白(VP1)的生物学特性,本试验对其进行全基因组序列测定,并应用分子生物学软件将DHAV GX株与DHAV 3个血清型参考毒株进行序列比对分析。结果显示,其基因组全长7 800bp,由5′和3′非编码区(UTR)和一个大开放阅读框(ORF)组成。其中,5′UTR和3′UTR的长度分别为652和369bp;ORF长度为6 756bp,编码2 251个氨基酸长的多聚蛋白,其编码产物至少有12个(VP0/VP3/VP1/2A1/2A2/2A3/2B/2C/3A/3B/3C/3D);在分类地位上DHAV GX株属于DHAV-3,其与DHAV-3参考株核苷酸、氨基酸同源性最高;与DHAV-3FS株亲缘关系最近,在同一较小分支上。DHAV GX株结构蛋白VP1以第195—201、211—221位氨基酸区段为B细胞优势表位的可能性较大。提示,VP1基因可作为研制DHAV基因工程疫苗的优势候选基因。

分类号： S852.65

  • 相关文献

[1]FMDV OA/58病毒株VP1蛋白结构构建与B细胞抗原表位的预测. 周建华,丛国正,高闪电,常惠芸. 2007

[2]FMDVOA/58病毒株VP1蛋白结构构建与B细胞抗原表位的预测. 周建华,丛国正,高闪电,常惠芸. 2007

[3]FMDV OA／58病毒株VP1蛋白结构构建与B细胞抗原表位的预测. 周建华,丛国正,高闪电,常惠芸. 2007

[4]弓形虫致密颗粒蛋白14基因的克隆及序列分析. 陈锐钊,张念章,聂子雄,周东辉,袁子国. 2013

[5]弓形虫profilin蛋白基因的克隆表达及序列分析. 高琦,张念章,胡玲英,朱兴全,翁亚彪. 2015

[6]犬细小病毒JL-M13株的分离鉴定及全基因组序列分析. 仝明薇,易立,程世鹏. 2015

[7]猪圆环病毒2型吉林分离株全基因组的克隆与序列分析. 杨博超,王凤雪,温永俊,李建喜,杨志强,武华. 2013

[8]1型鸭肝炎病毒E53株和HP-1株全基因组序列分析. 陈晓丹,张云,王钰,郭冬春,李永锋. 2009

[9]鸭坦布苏病毒AH-F10株全基因组的分子克隆与序列分析. 王楠楠,姜安安,王蓓,王晓旭,毕庄莉,唐井玉,刘光清,王桂军. 2014

[10]犬细小病毒JL-M13株分离鉴定及全基因组序列分析. 仝明薇,易立,程世鹏,孙长英,王文宪. 2014

[11]猪源乙型脑炎病毒HEN0701株全基因组的分子特征. 郑浩,孙春清,袁世山. 2011

[12]犬瘟热病毒AH株全基因组序列测定及其分子特征. 刘柱,李丹丹,李琦,宫晓华,缪秋红,李传峰,陈宗艳,张淼涛,刘光清. 2017

[13]鹅细小病毒弱毒株的培育及其致弱前后全基因组中核酸变异的分析. 张青山,李晨曦,刘明,邵周伍林,张云. 2016

[14]猪水泡病病毒全基因组核苷酸序列的测定与分析. 冶贵生,刘湘涛,张彦明,马玉花,张淼涛,韩雪清,张永国,谢庆阁. 2005

[15]鸡传染性支气管炎病毒分离株CK/CH/HD/171018的生物学特性及其全基因组序列分析. 李智超,王友令,徐腾飞,栗永华,车路平,刘盼娆,仇旭升,孙英杰,谭磊,廖瑛,宋翠萍,丁铲,姚刚,孟春春,王金泉. 2018

[16]密码子优化型鸭甲肝病毒VP1基因在昆虫细胞中的表达. 李传峰,陈宗艳,孟春春,梁瑞英,胡文,刘光清. 2014

[17]鸭甲肝病毒VP1蛋白主要抗原域的原核表达及间接ELISA方法的初步建立. 孙涛,李传峰,徐彪,邓明俊,岳志芹. 2015

[18]新城疫病毒La Sota株F蛋白结构与部分功能区的预测. 张晓东,刘怀然,刘培欣,闫丽辉,刘胜旺,孔宪刚. 2007

[19]鸭甲型肝炎病毒衣壳蛋白B细胞抗原表位和密码子偏爱性的分析. 李传峰,陈宗艳,刘光清. 2012

[20]口蹄疫OA/58病毒株VP2蛋白结构模拟与B细胞抗原表位的分析. 周建华,丛国正,高闪电,常惠芸. 2008

作者其他论文 更多>>