数字农科院2.0

苹果MdJAZ1基因表达及蛋白互作分析

文献类型: 中文期刊

作者: 安秀红;厉恩茂;李敏;李壮;张修德;程存刚

作者机构:

关键词: 苹果;茉莉酸;MdJAZ1;表达;蛋白互作

期刊名称:中国农业科学

ISSN: 0578-1752

年卷期: 2016 年 49 卷 13 期

页码: 2642-2650

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】克隆苹果茉莉酸信号途径阻遏因子基因MdJAZ1,并对其表达及蛋白互作进行分析,为进一步研究MdJAZ1的功能奠定基础。【方法】以TIFY及Jas功能域为探针,在苹果基因组中进行比对,获得多个同源基因,对其中的一个基因设计引物进行克隆;利用DNAMan软件对该基因编码蛋白的分子量、等电点进行预测;利用SMART在线分析软件对该蛋白的功能域进行分析;利用MEGA5.0对该蛋白与拟南芥JAZ家族蛋白构建系统发育树;利用荧光定量PCR分析该基因在苹果不同组织器官、茉莉酸甲酯及创伤处理下的表达情况;利用Plant CARE在线软件分析该基因启动子区域的顺式作用元件;利用酵母双杂交系统检测MdJAZ1蛋白的二聚化及其与拟南芥AtCOI1蛋白的互作关系。【结果】MdJAZ1开放阅读框为1 149 bp,编码382个氨基酸残基,其蛋白的分子量为40.536kDa,等电点9。氨基酸序列分析显示,该蛋白包含保守的TIFY及Jas结构域;系统发育树分析显示,MdJAZ1蛋白与拟南芥JAZ家族AtJAZ3、AtJAZ4亲缘关系最近;qPCR结果显示,MdJAZ1在苹果的根、茎、叶、花及果实等组织中都有表达,但表达水平存在明显差异,其中根中的表达量最高,果实中的表达量最低;该基因还能被茉莉酸甲酯及创伤处理诱导表达,均在1 h内达到最高表达水平;启动子分析显示,MdJAZ1启动子中包含多个ABA、乙烯、抗病及逆境胁迫等响应元件,此外,还包含多个MYB结合位点;酵母双杂交结果显示,MdJAZ1蛋白能与其自身相互作用形成同源二聚体,还可与拟南芥中同源性较近的AtJAZ3、AtJAZ4蛋白相互作用形成异源二聚体,并且在冠菌素存在时,MdJAZ1蛋白可与拟南芥F-box蛋白AtCOI1相互作用。【结论】MdJAZ1受茉莉酸甲酯及创伤诱导表达,其蛋白能形成同源及异源二聚体,且在冠菌素存在时可与AtCOI1互作。

分类号: S661.1

  • 相关文献

[1]小麦转录因子基因TaWRKY33的耐盐性分析. 张惠媛,刘永伟,杨军峰,张双喜,于太飞,陈隽,陈明,周永斌,马有志,徐兆师,付金东. 2018

[2]利用GFP-Trap技术筛选与TaTLP1相互作用的蛋白. 王菲,杨毅清,武文月,崔钟池,王海燕,刘大群. 2020

[3]植物VQ蛋白研究进展. 张高原,张一卉,李景娟,李化银,王凤德,高建伟. 2017

[4]月季切花乙烯受体RhETR3互作蛋白RhTSPO1的筛选和鉴定. 杨若韵,陈雯,薛璟祺,田佶,张帅,朱春彦,高俊平,马男. 2014

[5]拟南芥G蛋白α亚基GPA1互作蛋白铜离子结合蛋白AtBCB的鉴定及功能分析. 张小红,许鹏博,郭萌萌,徐兆师,李连城,陈明,马有志. 2013

[6]禽流感病毒NS1蛋白与ANXA2蛋白相互作用的研究. 马勇,包红梅,王文超,孙佳善,赵玉辉,王秀荣,陈化兰. 2015

[7]小麦蛋白激酶TaMAPK2互作蛋白的筛选与验证. 于太飞,徐兆师,李盼松,陈明,李连城,张俊华,马有志. 2014

[8]小麦ERF转录因子W17互作蛋白的筛选和解析. 邱志刚,徐兆师,郑天慧,李连城,陈明,马有志. 2011

[9]酵母双杂交筛选华北大黑鳃金龟触角均一化cDNA文库. 尹姣,李克斌,曹雅忠. 2013

[10]拟南芥液泡分拣蛋白AtVPS25调控植物生长素响应的功能分析. 郭萌萌,陈明,刘荣榜,马有志,李连成,徐兆师,张小红. 2014

[11]酵母双杂交技术在互作组学中的研究进展. 尹姣,李克斌,曹雅忠. 2012

[12]抗小麦黄矮病相关蛋白激酶TiDPK1与BYDV外壳蛋白的互作. 汪信东,陈亮,张增艳. 2013

[13]林烟草蛋白激酶NsylCIPK3基因的克隆与功能分析. 董连红,史素娟,S M Nuruzzaman Manik,苏玉龙,毛静静,王傚弘,周开燕,刘林,王倩. 2015

[14]小麦锌指转录因子TaDi19A对低温的响应及其互作蛋白的筛选. 茹京娜,于太飞,陈隽,陈明,周永斌,马有志,徐兆师,闵东红. 2017

[15]大豆锌指转录因子GmDi19-5对高温的响应及互作蛋白的筛选. 赵娟莹,刘佳明,冯志娟,陈明,周永斌,陈隽,徐兆师,郭长虹. 2017

[16]弓形虫微线体蛋白6,7,8与宿主Spata3,Dkk2蛋白相互作用的研究. 刘卿,李法财,杨文彬,刘国华,赵权,朱兴全. 2017

[17]伪狂犬病病毒UL56蛋白与宿主蛋白Nedd4相互作用的研究. 王书文,吕闯,蔡雪辉. 2019

[18]流感病毒PA蛋白与宿主蛋白PCBP1的相互作用. 赵青青,李俊平,梁立滨,黄山雨,周陈陈,赵玉辉,王倩,周圆,姜丽,陈化兰,李呈军. 2018

[19]蛋白激发子PeaT1互作蛋白的鉴定及功能分析. 邱德文,杨秀芬. 2012

[20]拟南芥H~+_-焦磷酸化酶AVP1互作小GTP结合蛋白AtRAB的特性鉴定与功能分析. 刘荣榜,陈明,郭萌萌,司青林,高世庆,徐兆师,李连城,马有志,尹钧. 2014

作者其他论文 更多>>