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敖鲁古雅驯鹿SRY基因的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 何金明;鞠妍;邢秀梅;王磊;董依萌;鞠贵春

作者机构：

关键词： 敖鲁古雅驯鹿;SRY基因;cDNA序列;生物信息学分析;系统进化分析

期刊名称：吉林农业大学学报

ISSN： 1000-5684

年卷期： 2022 年 1 期

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; CSCD（2021-2022年度） ; 科技核心（2021版） ; 农林核心（2020版）

摘要： 对敖鲁古雅驯鹿SRY(Sex-determiningregion of Y-chromosome)基因的cDNA序列进行测序及初步生物信息学分析.运用RT-PCR技术从敖鲁古雅驯鹿鹿茸组织中扩增SRY基因的cDNA序列,利用生物信息学软件对敖鲁古雅驯鹿SRY基因的cDNA序列及蛋白质结构进行分析,同时构建系统发育树.结果表明:扩增的敖鲁古雅驯鹿SRY基因的cDNA序列与GenBank数据库中登录的驯鹿SRY基因的cDNA序列(登录号AB247629.1)一致,全长690 bp.敖鲁古雅驯鹿SRY基因编码229个氨基酸;敖鲁古雅驯鹿SRY蛋白无信号肽和跨膜结构;结合其二级结构和结构域预测分析,SRY蛋白的二级结构以无规则卷曲和α-螺旋为主,具有HMG结构域.通过构建NJ系统发育树,发现敖鲁古雅驯鹿与白尾鹿之间的亲缘关系相对较近.研究结果为深入探索敖鲁古雅驯鹿SRY基因的生物学功能提供了基础参考.

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