小麦Lhc基因家族鉴定与表达模式分析
文献类型: 中文期刊
作者: 赵奇;茹京娜;李宜统;王超;徐兆师;王睿辉
作者机构:
关键词: 小麦;Lhc基因家族;表达分析;非生物胁迫
期刊名称:植物遗传资源学报
ISSN: 1672-1810
年卷期: 2022 年
页码:
收录情况: 北大核心(2020版) ; CSCD(2021-2022年度) ; 科技核心(2021版) ; 农林核心(2020版)
摘要: 捕光叶绿素a/b结合蛋白(light-harvesting chlorophyll a/b-binding protein,Lhc)直接影响光合系统的效率和作物产量。小麦作为我国主要粮食作物之一,生长发育过程中,非生物胁迫严重影响小麦的产量和品质。为了系统研究小麦Lhc基因家族的特性,本研究对小麦中的Lhc成员进行了生物信息学分析,并对其中的差异显著或高表达基因进行了定量表达分析。结果显示,从小麦基因组中共鉴定到96个Lhc基因,除4个基因(TaLhca5.1、TaLhcb1.31、TaLhcb1.39和TaLhcb1.29)未定位到具体染色体外,其余基因分布于除3A和3D外的19条染色体上;这些Lhc基因在系统发育上分属于3个亚家族,处于同一分支的基因具有相似的基因结构与motif;在Lhc基因的启动子区域,发现存在大量的胁迫响应元件和生长发育相关响应元件;Lhc基因在根、茎、叶、穗和籽粒等器官中的表达模式不同,其中在叶中的表达较高;在对所选的4个基因中,TaLhca3.3、TaLhcb1.7和TaLhcb1.20的表达量呈现先升高后降低的趋势,TaLhcb1.46呈下调表达趋势。
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