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陆地棉OFP基因家族的全基因组鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 窦玲玲;田再垄;李婷婷;马雄风;肖光辉

作者机构：

关键词： 陆地棉;OFP基因;系统进化;表达分析

期刊名称：中国科学:生命科学

ISSN： 1674-7232

年卷期： 2022 年

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; CSCD（2021-2022年度） ; 科技核心（2021版）

摘要： OVATE Family Protein（OFP）是一类植物特异性转录因子,广泛参与植物的生长发育,其在棉花中的研究尚未见报道.本研究从陆地棉NDM8基因组中共鉴定到61个GhOFP基因,系统聚类将其分为6个亚组（CladeⅠ,Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ,Ⅴ和Ⅵ）.转录组和qRT-PCR分析表明,棉纤维发育的起始和伸长阶段高调表达的GhOFP基因主要分布在CladeⅡ亚组,且该亚组的GhOFP基因启动子含有促进伸长生长的赤霉素和生长素响应的顺式元件;在棉纤维发育的次级细胞壁加厚阶段高调表达的GhOFP基因主要分布在CladeⅥ亚组,且该亚组的GhOFP基因启动子含有参与细胞壁生长的脱落酸、茉莉酸和水杨酸响应的顺式元件.陆地棉GhOFP基因家族的全基因组鉴定和分析将为进一步研究棉花GhOFP基因在棉纤维发育过程中的生物学功能提供参考.

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