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2011年猪流行性腹泻病毒的遗传变异分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘孝珍;陈建飞;时洪艳;张鑫;石达;刘胜旺;冯力

作者机构：

关键词： 猪流行性腹泻病毒;遗传变异;S1基因

期刊名称：中国预防兽医学报

ISSN： 1008-0589

年卷期： 2012 年 34 卷 03 期

页码： 180-183

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为分析猪流行性腹泻病毒(PEDV)的遗传变异情况,本研究设计合成2对扩增S1基因的引物,利用套式RT-PCR方法,对2011年分离的17个PEDV S1基因进行扩增、克隆和序列测定;并将其进行比对和遗传演化分析。结果表明:17个PEDV S1基因序列与参考病毒株S1基因核苷酸序列同源性为90.54%～99.96%,与经典病毒株CV777相比,其中有6个S1基因在453 bp～454 bp处存在3个核苷酸的缺失;一个在453 bp～454 bp处缺失6个核苷酸;其它10个S1基因在173 bp～186 bp之间存在12个核苷酸的插入,413 bp～417 bp之间有3个核苷酸的插入,467 bp～468 bp处缺失6个核苷酸,插入和缺失位点与韩国病毒株KNU-0901、KNU-0905、KNU-0801相似。S1基因系统进化树分析表明,PEDV S1基因分为3群,其中7个S1基因属于PEDVⅠ群,另外10个属于PEDVⅢ群。

分类号： S852.65

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