数字农科院2.0

宿根矮化病菌诱导甘蔗差异表达基因的cDNA-SCoT分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张保青;宋修鹏;陈虎;杨丽涛;李杨瑞;陈保善

作者机构：

关键词： 甘蔗;宿根矮化病;cDNA-SCoT;差异基因

期刊名称：作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2013 年 39 卷 06 期

页码： 1119-1126

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 宿根矮化病是危害严重的世界性甘蔗主要病害之一,为了探究甘蔗在该病胁迫下的抗病分子机制,本研究以甘蔗品种新台糖22健康植株为材料,利用含有宿根矮化病病原菌的蔗汁诱导其抗性,分别在接种后2、4、6、8和10d取样,构建宿根矮化病侵染处理与对照的RNA混合池,利用cDNA-SCoT法进行差异显示研究。结果表明,80条SCoT引物扩增出500多条带,长度在100~1800bp之间。从中筛选出30个差异明显的条带,测序后序列拼接,获得22条高质量的EST序列。生物信息学分析显示,对甘蔗宿根矮化病的差异基因主要涉及能量代谢、防卫反应、信号转导、蛋白质类代谢等方面。进一步基因功能分析显示,油菜素内酯合成蛋白、NBS-LRR类抗性蛋白、茉莉酸诱导蛋白、α-微管蛋白、ABA胁迫成熟蛋白、富含脯氨酸蛋白、翻译起始因子eif-2bα亚族等可能参与了甘蔗宿根矮化病病原菌互作的过程。

分类号： S435.661

  • 相关文献

[1]赤霉素诱导甘蔗节间伸长基因的cDNA-SCoT差异表达分析. 吴建明,李杨瑞,王爱勤,杨柳,杨丽涛. 2010

[2]低温胁迫下甘蔗抗寒相关基因的cDNA-SCOT差异显示. 李杨瑞,杨丽涛,吴建明,罗聪,熊发前,杨柳. 2010

[3]cDNA-SCOT基因差异表达两种电泳方法的比较研究. 李杨瑞,杨丽涛,吴建明,熊发前,罗聪. 2010

[4]甘蔗宿根矮化病研究进展. 杨丽涛,谢晓娜,刘光玲,孙富,杨建波,李杨瑞. 2011

[5]甘蔗种质资源抗宿根矮化病特性鉴定. 范业赓,莫璋红,吴凯朝,李鸣,秦新民,梁俊. 2012

[6]甘蔗宿根矮化病菌形态特征及其对甘蔗光合作用的影响. 梁永检,唐云仙,邵敏,杨丽涛,李杨瑞. 2015

[7]宿根矮化病菌侵染后甘蔗防御酶活性变化. 张小秋,梁永检,杨丽涛,李杨瑞. 2014

[8]广西主要蔗区甘蔗宿根矮化病调查. 韦金菊,宋修鹏,黄伟华,覃振强,张荣华,刘璐,邓展云,李杨瑞. 2017

[9]甘蔗宿根矮化病PCR检测技术优化分析. 谢晓娜,陈明辉,杨丽涛,李杨瑞. 2012

[10]宿根矮化病菌对甘蔗生长和内源激素的影响. 黄杏,谢晓娜,杨丽涛,李杨瑞,陈保善. 2013

[11]基因差异表达技术cDNA-SCoT在植物上的研究应用. 陈荣发,黄杏,吴建明,李杨瑞,李强,罗含敏. 2016

[12]鸡球虫抗药性相关差异基因和蛋白研究进展. 夏延富,陈兆国,米荣升,陈铁桥,沈辉. 2009

[13]高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒感染猪肺泡巨噬细胞的差异转录基因文库构建. 肖燕,安同庆,田志军,韦天超,姜一峰,彭金美,周艳君,仇华吉,童光志. 2009

[14]高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒感染后猪肺泡巨噬细胞的差异转录基因文库的构建. 肖燕,安同庆,田志军,韦天超,姜一峰,周艳君,彭金美,仇华吉,童光志. 2008

[15]胸膜肺炎放线杆菌血清1型与5型基因组DNA差异基因的筛选与鉴定. 谢芳,韩文瑜,杜崇涛,周靓,杨舒心,雷连成. 2010

[16]转录组比较分析中棉所63与亲本的叶片和幼蕾基因表达差异. 杨代刚,周晓箭,王海风,孟清芹,裴小雨,张文生,周克海. 2012

[17]棉铃虫Bt抗感品系的转录组差异表达分析. 刘运泽,张丹丹,曲爱军,郑方强,萧玉涛. 2019

[18]水杨酸诱导苹果抗轮纹病差异表达基因分析. 侯珲,周增强,王丽,王生荣. 2020

[19]基于转录组测序的紫芽茶树花青素合成相关基因分析. 蒋会兵,夏丽飞,田易萍,戴伟东,陈林波. 2018

[20]不同品种茶树新梢响应"倒春寒"的转录组分析. 王君雅,陈玮,刘丁丁,陈亮,姚明哲,马春雷. 2019

作者其他论文 更多>>