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基于MAGIC群体的烟草抗黑胫病全基因组关联分析

文献类型: 中文期刊

作者: 潘怡;刘洪泰;吉白璐;王红;黄立钰;程立锐

作者机构:

关键词: MAGIC群体;烟草;黑胫病;GWAS

期刊名称:热带农业科学

ISSN: 1009-2196

年卷期: 2024 年

页码:

收录情况: 科技核心(2024版) ; ; 农林核心(2020版)

摘要: 由烟草疫霉引起的黑胫病是烟草主要病害之一,严重影响烟叶的产量和品质。为了进一步明确烟草黑胫病抗性遗传基础,发掘烟草黑胫病抗性位点,本研究采用8亲本组配的MAGIC(Multiparent Advanced Generation Inter-Cross)群体为试验材料,在苗期和大田期调查亲本及后代群体的黑胫病抗性,利用430 K烟草SNP(Single Nucleotide Polymorphism)芯片鉴定基因型,并对烟草黑胫病不同生育期抗性进行全基因组关联分析(Genome-Wide Association Study, GWAS)。结果显示,在苗期和大田期重复定位到2个与黑胫病病情指数及发病率相关的黑胫病抗性主效QTL(Quantitative Trait Locus),分别位于7号和14号染色体,最显著SNP物理位置分别在7号染色体175 557 310 bp和14号染色体7 074 846 bp。其中,7号染色体定位结果与前人研究结果一致,14号染色体定位结果为烟草黑胫病抗性新位点。本研究为深入挖掘烟草抗黑胫病主效基因和开展抗性分子标记辅助改良提供一定的参考。

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