基于基因组和系谱信息的不同选配方案效果模拟研究
文献类型: 中文期刊
作者: 张鹏飞;何俊;王立贤;赵福平
作者机构:
关键词: 模拟数据;基因组选择;基因组选配;遗传进展;近交
期刊名称:畜牧兽医学报
ISSN: 0366-6964
年卷期: 2022 年
页码:
收录情况: 北大核心(2020版) ; CSCD(2021-2022年度) ; 科技核心(2021版) ; 农林核心(2020版)
摘要: 基因组选配(genomic mating,GM)是利用基因组信息进行优化的选种选配,可以有效控制群体近交水平的同时实现最大化的遗传进展。但基因组选配是对群体中所有个体进行选配,这与实际的育种工作有点相悖。本研究模拟了遗传力为0.5的9 000头个体的基础群数据,每个世代根据GEBV选择30头公畜、900头母畜作为种用个体,而后使用基因组选配、同质选配、异质选配、随机交配4种不同的选配方案。其中基因组选配中分别选取遗传进展最大的解、家系间方差最大的解、近交最小的解所对应的交配方案进行选育。每种方案选育5个世代,比较其后代群体的平均GEBV、每世代的遗传进展、近交系数、遗传方差,并重复5次取平均值。结果表明,3种基因组选配方案的△G均显著高于随机交配和异质选配(P<0.01),而且,选取遗传进展最大的基因组选配方案的△G比同质选配还高出4.3%。3种基因组选配的方案的△F比同质选配低22.2%~94.1%,而且选取近交最小的基因组选配方案△F比异质选配低11.8%。同质选配的遗传方差迅速降低,在第5世代显著低于除基因组选配中选择遗传进展最大的方案以外的所有方案(P<0.05),3种基因组选配方案的遗传方差比同质选配高10.8%~32.2%。这表明基因组选配不仅可以获得比同质选配更高的遗传进展,同时有效的降低了近交水平,并且减缓了遗传方差降低速度,保证了一定的遗传变异。基因组选配作为一种有效的可持续育种方法,在畜禽育种中开展十分有必要。
分类号:
- 相关文献
[1]基因组选配研究及其在畜禽育种中的应用. 王元清,王兢,朱波,陈燕,徐凌洋,王泽昭,张路培,高会江,李俊雅,高雪. 2023
[2]场内遗传改良计划与联合育种. 王立贤. 2010
[3]蜜蜂高产杂交种“华蜂213”和“华蜂414”的选育. 刘先蜀,石巍,蒙小平,霍炜,吴曙,曹乐元,汪大海,喻积雄,杜桃柱,张映生,郑永会. 1992
[4]应用微卫星DNA标记对BWEL-SPF鸡种群遗传学分析. 肖兵兵,韩凌霞,于海波,司昌德,徐佳,曲连东,韩建林. 2008
[5]蜜蜂高产杂交种"华蜂213"和"华蜂414"的选育. 刘先蜀,石巍,蒙小平,霍炜,吴曙,曹乐元,汪大海,喻积雄,杜桃柱,张映生. 1992
[6]天山马鹿清原品系茸重性状的选择差及遗传进展. 李生,郑兴涛,邴国良,李和平,赵蒙. 1998
[7]中国北方肉绵羊新品种MOET育种计划方案的设计及遗传进展预估. 梁春年,杨博辉,郭健,程胜利,牛春娥,郎侠. 2006
[8]鲁西黄牛肉用品系核心群育种方案遗传和经济评估. 张清峰,许尚忠. 2010
[9]中国西门塔尔牛产奶量育种值不同估测方法的比较研究. 陈幼春,许尚忠,贾恩棠. 1993
[10]我国肉用西门塔尔牛群体生长发育性状遗传参数估计及其遗传进展. 朱波,李姣,汪聪勇,徐凌洋,陈燕,高雪,张路培,高会江,李俊雅. 2020
[11]燕麦分子育种研究进展. 吴斌,郑殿升,严威凯,申状状,晏林,张宗文. 2019
[12]基因组选择在羊育种中的应用研究进展. 张统雨,魏霞,张勤,杜立新,王立贤,赵福平. 2018
[13]西门塔尔牛饱和脂肪酸含量的低密度芯片基因组预测. 齐欣,张静静,樊惠中,李娟,胡鑫,刘飞,朱波,高雪,陈燕. 2016
[14]畜禽基因组选择中贝叶斯方法及其参数优化策略. 朱波,王延晖,牛红,陈燕,张路培,高会江,高雪,李俊雅,孙少华. 2014
[15]新西兰苹果品种及砧木育种成就与对中国的启示. 张恒涛,BUSVincent G·M·,WHITEAllan G·,阎振立,过国南,张瑞萍,刘珍珍,YAO Jia-long,CHAGNé David. 2016
[16]中国肉牛种业整体发展现状与趋势. 高雪. 2021
[17]肉鸡种业技术发展趋势. 赵桂苹. 2021
[18]新西兰苹果品种及苹果砧木育种成就与启示. 张恒涛,BUSVincentG.M.,WHITEAllan,阎振立,过国南,张瑞萍,刘珍珍,YAOJia-long,CHAGNéDavid. 2016
[19]快速型黄羽肉鸡饲料利用效率性状的基因组选择研究. 李森,杜永旺,文杰,黄超,陈智武,赵桂苹,郑麦青. 2021
[20]基于GBLUP等模型对梅花鹿(Cervus Nippon)生长相关性状基因组选择的预测准确性比较. 李浩东,闵祥玉,周雅,张禾垟,郑军军,刘琳玲,王平,王艳梅,杨福合,王桂武. 2022
作者其他论文 更多>>
-
基于基因组SNP和ROH的剑白香猪群体遗传结构解析
作者:胡紫平;王立刚;宗文成;侯任达;苏艳芳;牛乃琪;王立贤;王源;张龙超
关键词:剑白香猪;群体结构;ROH;SNP;遗传多样性
-
母猪的母性行为及其影响因素研究进展
作者:李寒妹;颜华;刘欣;王立贤
关键词:母猪;母性行为;调控机制;影响因素
-
温室大棚内不同灌溉量条件下水分迁移特征研究
作者:钞锦龙;张冬晖;刘玉鹏;路亚敏;张鹏飞;雷添杰
关键词:温室大棚;灌溉量;土壤水分;水分迁移特征
-
机器学习在动物基因组选择中的研究进展
作者:李棉燕;王立贤;赵福平
关键词:机器学习;深度学习;基因组选择;动物育种
-
大白猪仔猪感染流行性腹泻病毒后空肠转录组学变化研究
作者:李慧慧;张美美;元娜;张龙超;王立贤;石丽君
关键词:大白猪仔猪;猪流行性腹泻病毒(PEDV);转录组;功能富集
-
北京黑猪AQP9和RPS10基因多态性及其与背膘厚的关联分析
作者:祝雪丽;张龙超;王立贤;蒲蕾;刘欣
关键词:北京黑猪;AQP9;RPS10;背膘厚度;关联分析
-
水稻叶片融合基因LF1的图位克隆及功能分析
作者:谭嵩娟;陶蓉;何俊;刘裕强;万建民
关键词:水稻;叶片分化;基因克隆;NAC转录因子