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基于基因组SNP和ROH的剑白香猪群体遗传结构解析

文献类型： 中文期刊

作者： 胡紫平;王立刚;宗文成;侯任达;苏艳芳;牛乃琪;王立贤;王源;张龙超

作者机构：

关键词： 剑白香猪;群体结构;ROH;SNP;遗传多样性

期刊名称：畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2023 年

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2023版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 旨在从分子水平分析剑白香猪的群体结构以及遗传多样性，对剑白香猪的种质资源鉴定和保护提供技术支持。本研究利用Porcine SNP50 BeadChip （Illumina， United States）芯片对138头剑白香猪的全基因组SNP进行扫描，通过对主成分、遗传距离、亲缘关系和公猪血统进行分析，研究剑白香猪的群体结构；通过ROH分析，确定剑白香猪的遗传多样性。结果显示，此剑白香猪群体无明显分层，但大致可以分为3个部分，群体内的遗传距离平均值约为0.273，所有公猪划分为4个血统；剑白香猪群体共检测出2 893个ROHs，平均每个个体约有21个ROHs，平均ROH长度约为7.18 Mb，平均近交系数(FROH)为0.27%，表明剑白香猪近交积累较少。通过多种分析表明，该群体家系数量适中，个别家系公畜数量较少，个体间亲缘关系中等，近交程度较低，群体的遗传多样性较高。本研究在基因组水平分析了剑白香猪的群体遗传结构和遗传多样性，为剑白香猪群体复壮和种业安全措施制定提供了分子依据。

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