文献类型： 中文期刊
作者： 胡紫平;苏艳芳;宗文成;牛乃琪;张龙超;王源
作者机构：
关键词： 剑白香猪;转录组;基因组;毛色;候选基因
期刊名称：中国畜牧兽医
ISSN： 1671-7236
年卷期： 2025 年 01 期
页码：
收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2025-2026年度） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2024版）
摘要： 【目的】剑白香猪的毛色表型多为两头乌,但影响其毛色表型的候选基因鲜见报道。试验旨在筛选影响剑白香猪两头乌毛色的候选基因。【方法】基于剑白香猪黑、白皮肤组织的转录组数据进行差异表达基因筛选,同时结合138头剑白香猪与130头北京黑猪50K芯片数据(Porcine SNP50 BeadChip)进行选择信号分析,通过GO功能和KEGG通路分析筛选影响剑白香猪毛色的候选基因。【结果】在转录组分析中,554个基因在黑、白毛色皮肤组织中差异表达,其中295个上调,259个下调。共筛选到6个GO条目和2条KEGG通路,获得TYR、TYRP1、DCT、PLCB4等12个与毛色形成相关的候选基因。基于基因组数据进行群体间遗传分化指数(Fst)分析共筛选到3个GO条目、4条KEGG通路中PLCB4、FZD8、WNT2等32个候选基因可能参与剑白香猪毛色形成过程。【结论】综合选择信号和转录组差异分析,两者共同筛选到的基因为PLCB4,可将其作为影响剑白香猪两头乌毛色表型的重要候选基因,为今后剑白香猪毛色形成相关分子调控机制研究提供参考。
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