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水稻耐寒基因CTB4a的核苷酸多样性及区域适应性研究

文献类型： 中文期刊

作者： 宋佳;职铭阳;陈强;李玥莹;吴隆坤;农保选;李丹婷;逄洪波;郑晓明

作者机构：

关键词： 栽培稻;CTB4a基因;核苷酸多样性;单倍型;适应性

期刊名称：生物多样性

ISSN： 1005-0094

年卷期： 2021 年

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; CSCD（2020-2021年度） ; 科技核心（2020版）

摘要： 为探究CTB4a基因的自然变异是否与栽培稻苗期耐低温相关,本研究以全世界有代表性的133份栽培稻（Oryzasativa L.）及35份普通野生稻（O.rufipogonGriff.）为实验材料,对CTB4a编码区的核苷酸多样性及其单倍型与地理分布的关系进行分析。结果表明CTB4a基因编码区有14个核苷酸变异,组成33个单倍型。这些单倍型的Network分析发现,286bp处的SNP变异（+2,035,097 bp, G> C;+96 aa, Ala→Pro）将这些单倍型分成Group A和Group B两组。其中, Group A （CTB4ajap）共有56份样品,有43份（占Group A的76.79%）是种植于在日本、韩国、台湾及北京等中高纬度地区的粳稻, Group B （CTB4aind）有77份样品,有63份（占GroupB的83.12%）是种植于中国南方地区以及热带和亚热带国家的籼稻。GroupA中样品苗期黄叶率的平均值比Group B样品黄叶率低30%,耐寒性具有显著差异（P=1.25e-09）。这个变异只存在于Group A中,在Group B中均不存在,说明随着水稻种植区域向北迁移的育种过程中,栽培稻中出现了CTB4ajap并被固定下来。该研究为理解水稻对低温适应的分子遗传机制和培育耐寒品种提供了理论基础。

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