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甘肃地区一株PCV-3流行毒株的全基因序列测定及遗传演化分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张辉;马雪青;袁红;李勇生;魏达礼;卢曾军;刘在新;韩庆彦;孙普

作者机构：

关键词： 猪圆环病毒3型;流行毒株;全基因组;遗传变异;基因缺失

期刊名称：黑龙江畜牧兽医

ISSN： 1004-7034

年卷期： 2023 年 13 期

页码：

收录情况： 北大核心（2020版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 为了了解甘肃地区猪圆环病毒（PCV）的基因特征，试验采用PCR方法和基因测序技术，对甘肃省2018—2022年期间发生流行性腹泻的死亡仔猪病料进行回顾性检测，并对获得的毒株进行全基因测序，同时与参考毒株序列进行基因特征分析。结果表明：试验成功获得一株PCV-3毒株，将其命名为GSJN/2/2018毒株，该毒株的全基因组序列长度为1 999 nt,在1 149 nt处缺失碱基G,与参考毒株全基因序列的核苷酸相似性为97.8%～99.8%;ORF1和ORF2基因与参考毒株的核苷酸和氨基酸序列相似性分别为98.8%～99.9%/97.0%～100%和96.4%～99.7%/94.4%～100%;基于全基因组序列、ORF1和ORF2基因序列分别构建的系统进化树均将GSJN/2/2018毒株划分为PCV-3a基因型；该毒株主要线性抗原表位和3个滚环复制基序FTINN、HLQG、YCKK没有发生变异。说明通过回顾性检测获得的甘肃地区流行较早的GSJN/2/2018毒株属于PCV-3a基因型，并发现了新的基因缺失，丰富了PCV-3的基因组信息。

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