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鸭甲型肝炎病毒衣壳蛋白B细胞抗原表位和密码子偏爱性的分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李传峰;陈宗艳;刘光清

作者机构：

关键词： 鸭甲型肝炎病毒;B细胞抗原表位;密码子偏爱性

期刊名称：中国兽医科学

ISSN： 1673-4696

年卷期： 2012 年 11 期

页码： 1112-1120

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了筛选血清1型鸭甲型肝炎病毒(DHAV)衣壳蛋白的优势B细胞抗原表位及其各结构蛋白的最佳宿主表达系统,通过RT-PCR获得DHAV衣壳蛋白的编码基因(P1基因)序列,并分别运用DNAStar和EMBOSS软件分析其B细胞抗原表位区和密码子偏爱性特征,然后进行各结构蛋白抗原性的Western-bolt分析以及与大肠杆菌、酵母及人的密码子偏爱性进行比较。结果显示,DHAV的优势B细胞抗原表位主要存在于VP1和VP3蛋白,且每种蛋白各包含2个潜在的优势B细胞抗原表位。DHAV 3种结构蛋白基因的ENc值分别为54.631、49.502和45.924。VP3和VP1蛋白与酵母的密码子偏爱性差异最小,VP0蛋白与人的密码子偏爱性差异最小。结果表明,3种结构蛋白密码子出现的频率较为均一。VP1和VP3蛋白均是DHAV基因工程疫苗研制的候选免疫原,且适宜在酵母表达系统中表达,而VP0蛋白更适宜在人源细胞中表达。

分类号： S852.659.6

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