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转录组和蛋白组联合揭示甜瓜响应涝害胁迫的分子机制

文献类型： 中文期刊

作者： 张焕欣;闫承璞;李国权;张新龙;曹娜;乐美旺;朱方红;刘文革

作者机构：

关键词： 甜瓜;涝害胁迫;转录组;蛋白组

期刊名称：核农学报

ISSN： 1000-8551

年卷期： 2024 年 38 卷 04 期

页码：

收录情况： 北大核心（2023版） ; ; CSCD（2023-2024年度） ; ; 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2020版）

摘要： 为了探析甜瓜（Cucumis melo L.）响应涝害胁迫的分子机制，采用转录组和蛋白组学方法研究了甜瓜耐涝型材料L45和涝敏感型材料L39在正常培养和涝害胁迫处理条件下的差异表达基因和蛋白。结果表明，L39-W vs L39-C的差异表达基因数为3 532个，差异表达蛋白数为105个；L45-W vs L45-C的差异表达基因数为1 842个，差异表达蛋白数为38个。转录组与蛋白组联合分析发现，L39-W vs L39-C中38个基因在mRNA和蛋白质水平上联合上调表达，12个基因联合下调表达；L45-W vs L45-C中7个基因联合上调表达，3个基因联合下调表达。KEGG显著性富集分析结果发现，L39-W vs L39-C中联合上调表达的基因显著富集在类黄酮生物合成、苯丙烷生物合成、苯丙氨酸代谢、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸生物合成、精氨酸和脯氨酸代谢等；而L45-W vs L45-C中联合上调表达的基因显著富集在α-亚麻酸代谢、类黄酮生物合成、苯丙烷生物合成、亚油酸代谢等。本研究联合转录组与蛋白组数据进行了差异表达基因与蛋白分析，为进一步挖掘甜瓜响应涝害胁迫的关键基因及通路奠定了一定基础。

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