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甜橙MYC转录因子家族全基因组生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 周家豪;张冀芳;邓勇;高泽昕;刘婕;唐瑄玥;吴卓迪;梁引库;栾明宝

作者机构：

关键词： MYC基因家族;系统发育;类黄酮

期刊名称：中国麻业科学

ISSN： 1671-3532

年卷期： 2025 年

页码：

收录情况： 科技核心（2024版） ; ; 农林核心（2024版）

摘要： 为深入了解柑橘次生代谢的分子机制和通过代谢工程手段提升柑橘营养价值，试验以甜橙为研究对象，采用生物信息学方法对CsMYC转录因子进行全基因组范围内鉴定与分析。研究发现共鉴定到14个CsMYC转录因子成员，分布在甜橙的4条染色体上。系统发育分析表明，甜橙中的CsMYC转录因子家族可以划分为4个亚家族，并且在同一亚家族中的大多数基因具有相似的基因结构和保守基序。对奉节脐橙（Citrus sinensis L. Osbeck “Fengjie 72-1”）和埃及艳后柑橘(Citrus sinensis L. Osbeck Cleopatra )甜橙转录组数据进行分析，发现CsMYC1在柑橘汁胞幼果中高量表达，CsMYC5在柑橘果实不同组织幼果中均高量表达，CsMYC11在柑橘白皮层（AL）与囊衣（SM）幼果中均高量表达。同时，CsMYC1、CsMYC2、CsMYC5和CsMYC11在热胁迫(HS)、水分胁迫和热胁迫组合 (WS+HS)有高量表达。通过蛋白互作分析可知，与CsMYC1、CsMYC2、CsMYC5和CsMYC11同源的基因AtMYC1、AtBHLH13、AtBHLH3和AtMYC2直接或间接调控类黄酮合成。这4个基因参与植物防御且均可能参与了柑橘果实类黄酮的生物合成。研究结果为CsMYC基因的功能研究奠定了基础。

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