文献类型： 中文期刊
作者： 钱方;胡利娟;余婕;冯群;左丹;方正;朱斌;伍晓明
作者机构：
关键词： 甘蓝型油菜;HIPPs基因家族;重金属;基因表达
期刊名称：植物遗传资源学报
ISSN： 1672-1810
年卷期： 2022 年
页码：
收录情况： 北大核心（2020版） ; CSCD（2021-2022年度） ; 科技核心（2021版） ; 农林核心（2020版）
摘要： HIPPs（heavy metal-associated isoprenylated plant proteins）是金属离子在植物细胞内安全运输的关键蛋白，在植物体金属离子稳态的维持过程中发挥重要作用。目前关于HIPPs基因家族的研究多集中于模式植物水稻（Oryza sativa L.）和拟南芥（Arabidopsis thaliana L.），在甘蓝型油菜（Brassica napus L.）中报道相对较少。本研究通过生物信息学的方法在甘蓝型油菜全基因组（Darmor-bzh v10）中鉴定到了不均匀分布在19条染色体上的104个BnaHIPPs基因。蛋白理化性质分析发现其氨基酸数目在120～630 aa，蛋白分子量在13827.56～64467.05 Da，蛋白疏水指数在-1.146到-0.17之间，平均等电点为8.07。基因表达模式分析发现它们在不同组织和发育时期的表达模式具有一定的时空表达特性，在根中的表达量最高。镉胁迫处理条件下BnaHIPPs的表达模式发生了改变，BnaA08p24150和BnaA09p41730在镉胁迫条件下在根和叶片中的相对表达水平都发生了上调。系统进化关系显示BnaHIPPs基因被分为5个亚家族。此外，共线性分析显示在BnaHIPPs基因的进化过程中，大多数的BnaHIPPs都是以片段复制的形式参与BnaHIPPs基因家族的扩张过程，仅发现BnaC05p3800、BnaC05p3810、BnaC05p3820和BnaC05p3830以串联重复的形式参与BnaHIPPs的复制事件。本研究结果将为甘蓝型油菜BnaHIPPs基因家族的进一步研究奠定基础。
分类号：
- 相关文献
[1]六个甘蓝型油菜油酸脱氢酶(FAD2)假基因的克隆和分析. 肖钢,张振乾,邬贤梦,谭太龙,官春云. 2010
[2]甘蓝型油菜AnnBn1基因的克隆和表达分析. 肖庆生,张学昆,许本波,程勇,郑普英,陆光远. 2012
[3]油菜干旱相关基因的表达与耐旱生理指标的相关性研究. 徐明月,肖庆生,张学昆,程勇,陆光远,徐劲松,曾柳,付桂萍,瞿桢,邹锡玲. 2013
[4]油菜干旱相关基因的表达及其与耐旱生理指标的相关性. 徐明月,肖庆生,张学昆,程勇,陆光远,徐劲松,曾柳,付桂萍,瞿桢,邹锡玲. 2013
[5]油菜F-box-LRR基因全基因组鉴定与核盘菌诱导应答分析. 左蓉,吴姗,刘杰,胡鸣,程晓晖,刘越英,白泽涛,刘胜毅. 2022
[6]甘蓝型油菜腺苷5'-磷酰硫酸还原酶(APR)基因家族的鉴定及其非生物胁迫下的响应. 张小雪,冀功海,穆雨,姜伟高,刘清云,王新发,顿小玲,任丽军. 2025
[7]芥菜型油菜NRAMP基因家族的鉴定与表达分析. 黎婷,王家琪,霍卫聪,吴金锋,彭佳师,周定港,严明理,张大为. 2023
[8]甘蓝型油菜DH群体种子活力性状的遗传分析. 蔡鑫,成洪涛,陆光远,梅德圣,桑世飞,付丽,王会,储文,丁炳莉,汪文祥,胡琼. 2019
[9]基于色彩与高斯模型的油菜图像根系分割. 刘金亚,刘昌华,许鲲. 2019
[10]甘蓝型油菜PIN家族基因的鉴定与生物信息学分析. 高堃,华营鹏,宋海星,官春云,张振华,周婷. 2018
[11]油菜开花期QTL定位和候选基因分析. 魏雅琪,危文亮,刘道敏,张江江,詹杰鹏,师家勤,王新发,刘贵华. 2019
[12]甘蓝型油菜BnaA06.mTERF1基因的功能及进化分析. 李双,叶姜,詹杰鹏,朱瑶瑶,危文亮,师家勤,王新发. 2020
[13]甘蓝型油菜千粒重性状的QTL定位分析. 赵卫国,王灏,穆建新,田建华,李保军,李龙华. 2017
[14]油菜株高QTL定位、整合和候选基因鉴定. 张江江,詹杰鹏,刘清云,师家勤,王新发,刘贵华,王汉中. 2017
[15]生态穿梭育种在油菜品种选育中的应用. 关周博,董育红,张耀文,田建华,赵卫国,赵小光,韦世豪,李少钦,张文学,王学芳,李殿荣. 2017
[16]5种磺酰脲类除草剂对甘蓝型油菜雄性不育的诱导效果. 李建厂,李永红,张振兰,郭徐鹏,张耀文,赵鹏涛,赵小光. 2018
[17]甘蓝型油菜BnGS3和BnGhd7的同源克隆及其与油菜产量相关性状的关系. 薛志飞,王夏,李付鹏,马朝芝. 2018
[18]GWAS结合共表达网络分析挖掘影响油菜种子硫苷积累的作用位点. 刘蔚,姚敏,康郁,王美,解盼,何昕,刘忠松,官春云,钱伟,华玮,钱论文. 2019
[19]甘蓝型油菜种质苗期氮素营养效率的鉴定与评价. 邹小云,刘宝林,宋来强,官春云. 2017
[20]甘蓝型油菜尿卟啉原Ⅲ合成酶基因BnHemd的克隆和功能分析. 郑潇潇,朱瑶瑶,梁华兵,詹杰鹏,师家勤,王新发. 2020
作者其他论文 更多>>
-
甘蓝型油菜全生育期极端耐渍种质评价鉴定体系的构建
作者：许梦然;代文君;许磊;Naseeb Ullah;周芳林;伍晓明;蔡光勤;耿入丹;闫贵欣
关键词：甘蓝型油菜;耐渍性;全生育期;评价体系
-
猪肉价格与牛肉价格波动的传导性研究——基于TVP-SV-VAR模型的实证
作者：肖嘉琳;方正;鄢朝辉
关键词：牛肉价格下跌;猪肉价格;价格传导;替代品;TVP-SV-VAR模型
-
基于压裂力筛选油菜抗裂角优异种质资源
作者：刘念;李浩;陈天花;侯信哲;李睿;王玲;徐宏;蔡庆澳;邓秀;朱宗河;闫贵欣;蔡光勤;伍晓明;张付贵;周可金
关键词：甘蓝型油菜;压裂力;抗裂角指数;种质资源筛选
-
甘蓝型油菜越冬期与成熟期氮效率的评价与鉴定
作者：朱佳荣;代文君;李浩;钱方;管文杰;薛羽君;许鲲;李利霞;周想春;周芳林;耿入丹;蔡光勤;陈碧云;伍晓明;闫贵欣
关键词：
-
中国粮食生态效率：水平测度、时空格局演变与影响因素
作者：王帅;王亚静;方正;吕昊泉;刘璐
关键词：粮食生产;粮食生态效率;时空格局;非参数Kernel密度估计
-
芥菜型油菜种子中神经酸、芥酸和油酸含量的遗传分析
作者：范一铭;吴金锋;李洪戈;李浩;陈碧云;闫贵欣;蔡光勤;伍晓明
关键词：芥菜型油菜;神经酸;芥酸;油酸;主基因+多基因;遗传模型
-
基于隶属函数法对甘蓝型油菜种质苗期耐低氮胁迫能力的综合评价
作者：陈敬东;余忆;鲁金春子;戴希刚;沈金雄;傅廷栋;伍晓明;曾长立;万何平
关键词：甘蓝型油菜;耐低氮胁迫能力;隶属函数法;苗期;氮肥利用率